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北京大学2012年硕士研究生招生专业目录已公布，详情如下。
| 数学科学学院 |
物理学院 |
化学与分子工程学院 |
生命科学学院 |
| 地球与空间科学学院 |
心理学系 |
软件与微电子学院 |
新闻与传播学院 |
| 中国语言文学系 |
历史学系 |
考古文博院 |
哲学系 |
| 国际关系学院 |
经济学院 |
光华管理学院 |
法学院 |
| 信息管理系 |
社会学系（含社会学人类学研究所） |
政府管理学院 |
外国语学院 |
| 马克思主义学院 |
体育教研部 |
艺术学院 |
对外汉语教育学院 |
| 信息科学技术学院 |
国家发展研究院 |
教育学院 |
人口研究所 |
| 前沿交叉学科研究院 |
工学院 |
城市与环境学院 |
环境科学与工程学院 |
| 分子医学研究所 |
基础医学院 |
药学院 |
公共卫生学院 |
| 护理学院 |
医学人文研究院 |
公共卫生学院（医学信息学中心） |
第一临床医学院 |
| 第二临床医学院 |
第三临床医学院 |
第四临床医学院（北京积水潭医院） |
口腔医学院 |
| 精神卫生研究所 |
临床肿瘤学院 |
第五临床医学院（卫生部北京医院） |
中日友好临床医学院（卫生部中日友好医院） |
| 第九临床医学院（北京世纪坛医院） |
航天临床医学院（航天中心医院） |
首都儿科研究所附属医院 |
民航临床医学院（北京民用航空总医院） |
| 深圳·北京大学∕香港科技大学医学中心（深圳医院） |
首钢总医院 |
北京地坛医院 |
解放军第３０２医院 |
| 解放军第３０６医院 |
北京回龙观医院 |
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