本博士点是我国中医领域第一批博士授点，先后被确定为上海市教委及国家中医药管理局重点学科点、博士后流动站。
　　
　　本学科创建于60年代后期，由老一代著名中医专家金寿山、张伯讷教授等所创。自那以后，我校中基教研室一直是全国中医基础学科的教学、科研和人才培训中心。学科点现有教授7名（其中3人为博士生导师）、副教授9名、讲师5名。学科带头人为吴敦序、方肇勤、何裕民教授。
　　
　　学科主要研究方向有三个：中医基础理临床应用研究、中医脏象学说实验研究和中医体质学说研究。中医基础理论临床应用研究和中医脏象学说实验研究，围绕中医药方法治疗具有优势的重大疾病，以分子生物学为主要技术手段，结合生化、免疫、生理、组织学等多手段从事以下几方面研究：有效中药防治哮喘作用机制的研究；有效中药防治肿瘤作用机制的研究；有效中药延缓衰老的研究；有效中药防治糖尿病的研究；有效中药防治心血管疾病的研究；针刺防治癫痫的研究。
　　
　　本学科研究曾获国家中医药管理局科技进步一等奖一项，国家级二等奖一项和其他级别奖多项，并多次发起相关的国际和国内学术会议，目前正在进行的科研项目有国家中医药管理局科研基金2项，上海市教委科研基金8项及其它基金共计17项。近5年来本学科已在国内外公开发表学术论文百余篇，出版专著或教材10本。
　　
　　本学科点自七十年代开始培养硕士研究生，八十年代开始培养博士研究生，九十年代建立博士后流动站。学科点逐步建立了中医基础理论中心实验室和文献、教学研究室，前者可开展生化、免疫、生理等实验，九十年代起重点配置了分子生物学研究仪器设备。自1978年恢复招收研究生以来，已培养了32名硕士和博士生，已经授予博士学位6人，硕士学位16人。