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甘肃农业大学食品科学与工程学院是甘肃省食品类学科专业最全、实力最强、研究水平最高的学院。学院成立于1988年，现有动物性食品营养与工程博士学位授权点，农产品加工与贮藏工程、营养与食品卫生学、食品科学、动物性食品营养与工程硕士学位授权点，食品加工与安全（农业推广）专业硕士学位授权点，食品科学与工程、生物工程、食品质量与安全三个全日制本科专业，食品科学与工程自学考试本科专业。已为社会培养了国家任务本科生毕业生793名，硕士毕业生85名，博士生1名，自考本专科生1500名。
学院教师现有教职员工45人，其中教授7人、副教授12人、讲师10人、助教14人、助理实验师3人、专职管理人员3人。教师中博士学位获得者20人，97%的教师拥有硕士学位，入选甘肃省“333”人才工程2人、“555”人才工程3人。70%的教师来自于澳大利亚悉尼大学、清华大学、江南大学、浙江大学、四川大学、兰州大学、北京科技大学、西北农林科技大学、西北大学、陕西师范大学等国内外著名院校。现有在校全日制本科生880名、硕士研究生120名、博士研究生7名、农业推广硕士研究生63人，各类在册函授、自学考试学生共计800人。
学院下设甘肃省农畜产品加工贮藏重点实验室、甘肃省果蔬加工示范实验室、甘肃省畜产品工程技术研究中心、甘肃省葡萄酒工程技术研究中心、甘肃省干酪素工程技术研究中心、甘肃农业大学雪顿生物乳业技术研究中心、临夏什锦集团清真食品研究所（挂靠）、甘肃农业大学食品科学与工程教学实验中心；与甘肃省进出口商品检疫检局中心实验室、甘肃省疾病控制中心实验室、甘肃省技术监督局食品质量检测中心、甘肃省轻纺研究院、莫高葡萄酒业有限公司、兰州庄园乳品有限公司、甘肃长城果汁有限公司、圣大方洲变性淀粉有限公司、荣华生化集团等20多家企事业单位建立了密切的合作关系和校外教学科研基地，为本科生培养及科学研究提供了保障。学院与美国、加拿大、法国、澳大利亚、德国、意大利、荷兰、日本、泰国、新西兰等国十多所院校和科研机构建立了业务往来，与中国科学院及国内绝大多数省市的兄弟院校建立了科研和教学协作关系。
近年来，主持和协作完成国家科技支撑计划，国家自然科学资金，国家星火科技项目，甘肃省科技支撑计划，甘肃省星火科技项目，甘肃省生物技术专项等科研项目30项，在研各类科研经费近1000万元，在牛羊肉加工、干酪素生产、马铃薯贮藏与加工、葡萄酒酿造、果蔬汁加工、农产品加工废弃物综合利用、采后生物学与技术等方面形成了自己的研究特色。其中获国家科技进步三等奖1项，省部级科技进步一等奖2项、二等奖3项、三等奖8项。在国内外各类学术刊物上发表论文478篇。出版各类专著24部，主编、参编教材20部，其中全国统编教材15部。推广科研成果32项，为企业新增产值1.5亿元，产生了显著的经济效益和社会效益，为推动我省农产品加工业和食品科技的发展做出了重要的贡献。
学院教书育人取得了显著成效，近几年20%以上的本科毕业生都能考取硕士研究生；学院大学生曾获全国“挑战杯”大学生课外科技作品竞赛三等奖；学院党委曾获“甘肃省先进基层党组织”；教师团队曾获“甘肃省师德建设先进集体”；学生团队曾获“甘肃省五四红旗团委”、“甘肃省大学生职业生涯规划大赛一等奖”等。
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