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西安交通大学医学院前身为国立北平大学医学院（1937年），随着历史的变迁曾几经易名，1956年称为西安医学院，1985年更名为西安医科大学，2000年4月经国务院批准，西安医科大学与西安交通大学、陕西财经学院实现三校合并，成为新的西安交通大学医学院。
学院地处西安市南郊，毗邻大雁塔、小雁塔、陕西历史博物馆、大唐芙蓉园等风景名胜，周边高校林立，文化底蕴深厚，是莘莘学子探索生命奥秘、实现救死扶伤理想的高等学府。
学院是我国培养高等医药人才的摇篮之一，是中国医学科学院分院，也是原卫生部十一所直属重点院校之一；1997年原西安医科大学六十年校庆之际，江泽民总书记为学院亲切题词：“培养优秀医学人才，攀登医学科学高峰”。
学院师资力量雄厚，现有教职工4000余名，其中正、副教授626名，中国科学院、工程院院士3名（兼职），博士生导师117名，国家、省部级有突出贡献专家13人，省级教学名师3人，外聘国内外客座、兼职教授35人。70年来为我国培养了近5万名高级医药学专门人才。学院目前在校学生4094名，其中博士生376名，硕士生984余名，本科生2291余名，留学生443名。
学院在本科生、研究生教育中形成了完善的培养、教育和管理体系。现有临床医学、口腔医学、护理学、法医学、预防医学、药学、制药工程等8个专业。本科教育强调专业教育和素质教育，实行“高标准、宽口径、厚基础、重实践、综合型、高素质”的培养模式，毕业生受到用人单位的好评。
学院下设29个系、6个中心、31个研究所（室）；有生理学、法医学和泌尿外科3个国家重点学科、8个省部级重点学科；9个省优势学科；3个教育部、卫生部重点实验室及4个省级重点实验室；学院临床医学专业为陕西省“名牌专业”，“生理学”、“诊断学”等26门课程为国家、省、校级“精品课程”；建有基础医学、临床医学、生物学3个一级学科博士后科研流动站，21个二级学科博士学位授予权点，47个硕士学位授予权点。
学院的3所直属附属临床教学医院，1所非直属临床教学医院学科齐全，名医荟萃，医术精湛、设备精良；4所临床教学医院皆是三级甲等医院，承担着学院各个专业的临床教学、临床见习、临床实习的教学任务；3所直属、非直属临床教学医院共有开放床位2539余张，是陕西省乃至西部地区规模最大、技术力量最强、最受广大患者欢迎的临床医疗基地；学院还有8所教学实习医院、18个教学生产实习基地，为医药学各个专业学生的实践教学提供优质的生产实习条件。
学院科研力量雄厚，学术气氛浓郁，仪器设备先进，新建的医学科学研究大平台为学院科研水平的提高提供了有力的保证；多年来先后承担国家及省部级基金资助项目数百项，获国家级、部省级科研成果奖近400项，获国家专利20余项。克山病、大骨节病两项研究成果曾获国际无机化学家协会“克劳斯?施瓦兹”奖。学院重视技术开发与科研成果的转化，研制成功国家级新药“复方沙棘籽油栓”、“心荣口服液”等。学院建有医学图书馆，藏书近百万册，办有学术期刊10余种；经过“985”、“211”等工程建设，学院整体办学实力得到很大提升，一流的教学条件和良好的教学环境为高素质、创新型医药学人才的培养提供了基本保障。
学院重视对外交流与合作，重视与校友的联系。先后同美国、英国、瑞典、澳大利亚、日本等十多个国家和地区的医学院校和卫生机构建立了合作关系；以各种形式派遣700多名骨干教师、管理人员出国交流和学习，每年有百余名外籍留学生来院学习；与世界卫生组织、美国中华医学基金会、联合国儿童基金会等国际组织和机构建立了长期的合作关系，累计受助经费达1500多万美元；1998年美国国务卿奥尔布赖特来校访问，亲手启动了中美远程医疗会诊系统；学院的校友遍及世界各地，为学院的发展和学院国际地位的提升起到了重要作用。
今天的西安交通大学医学院依托交通大学综合性大学人文、自然、理工科优势，传承交大110年优良传统，秉承七十年形成的“尚德尚医、求是求新”的医学精神，将继续为培养高质量医药学人才而努力奋斗。
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