学院现设植物病理学系、昆虫学系、农药学系3个教学系和植物病理学研究所，昆虫学研究所、农药学研究所以及一个植保技术推广服务中心；有植物保护、制药工程2个本科专业；有植物保护一级学科博士点1个，有植物保护博士后流动站1个，有植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学、有害生物治理生态工程、植保资源利用等5个二级学科博士、硕士学位授权点；植物病理学是国家重点学科，农业昆虫与害虫防治是国家重点（培育）学科，农药学是陕西省重点学科。

学院有植保资源与害虫治理教育部重点实验室、农业部农作物病虫害综合治理与系统学重点开放实验室、陕西省植物源农药研究与开发重点实验室、农业部农业有害生物无公害控制技术创新中心、陕西省生物农药工程技术研究中心、农业部太白小麦条锈病菌重点野外科学观测实验站、国家“985”工程“农业有害生物治理与生物源农药创新”科技创新平台、教育部、国家外专局“创新引智基地”、学校应用昆虫学重点实验室等12个省部以及学校科技创新科研平台；有一个中试基地及11个校外教学实践基地；目前亚洲最大的昆虫博物馆为我院创办，主办《昆虫分类学报》；收藏昆虫标本120多万号，植物真菌病害标本5万多号；中国昆虫学会蝴蝶分会，中国植物病理学会植物抗病育种专业委员会、陕西省昆虫学会、陕西省植物病理学会、陕西省植物保护学会均挂靠在我院。

学院现有教职工129人，其中教授、研究员29人，副教授，副研究员28人；博士生导师23人，硕士生导师44人；国家特聘专家2人，双聘院士2人，“长江学者”特聘教授、客座教授各1人，国家“百千万人才工程”入选者3人，国家杰出青年基金获得者1人，教育部“新世纪优秀人才支持计划”入选者5人，陕西省“三五人才”4人；全国先进工作者1人，全国模范教师1人，全国优秀教师1人，陕西省教学名师2人。

学院现有在校生1300人，其中博士研究生159人，硕士研究生318人，本科生823人，先后为社会培养人才4414人。著名植物病理学家、中国工程院院士李振岐教授、著名地衣真菌学家、中国科学院院士魏江春研究员、著名昆虫学家周尧教授是师生中的杰出代表。

学院在昆虫分类与标本馆建设、小麦条锈病、蚜虫传毒专化性和植物源农药研究与开发等方面的科研工作居国内领先水平。学院始终坚持以农作物病虫害成灾机理与综合治理为主攻方向，先后对影响我国农业生产可持续发展的重大病虫害的发生规律和控制技术开展了系统深入的研究，并取得了重大研究成果，其中小麦吸浆虫的发生规律、小麦条锈病大区流行规律、品种抗病性和病菌毒性变异、杀虫活性物质苦皮藤素的发现与应用研究、小麦赤霉病致病机理与防控关键技术等研究成果曾获国家科学大会奖、国家自然科学二等奖、国家科技进步二等奖等多项奖励。

近年来学院共承担国家“973”、“863”项目、国家自然科学基金、国家科技攻关及省部等各类科研项目436项，到位经费达7012万元。在核心以上学术期刊发表学术论文1251篇， SCI收录208篇。获省级科技成果奖24项，授权发明专利40项，出版编（专）著50部。

近5年来，学院与国内外40多所科教单位建立了合作关系，先后有国内外专家学者160余人次前来学院讲学或开展合作研究，派出专家教授80余人次前往美、英、德等10多个国家进行合作研究，并成功举办国内学术会议10余次，在学术上取得了长足的发展。

在新的时期，植物保护学院将继续弘扬传统，深化改革。以国家"985"农业有害生物治理与生物源农药创制科技创新平台为依托，全面实施人才强院战略，以学科建设为龙头，教学、科研为中心，促进产学研紧密结合，团结一致、共同奋进，打造一流人才梯队，创建一流学科，培养一流人才，争创一流成果，为把学院建成国际知名的高水平研究型学院而努力奋斗。