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福建农林大学食品科学与工程学科源于1958年的食品加工专业，1999年农产品加工及贮藏工程学科成为福建省重点学科，2003年设立农产品加工及贮藏工程博士点，2007年设立“食品科学与工程博士后科研流动站”（福建省内唯一），2011年设立食品科学与工程一级学科博士点（福建省内唯一）。经多年建设，食品科学与工程学科已建立了学历层次高、年龄结构合理的师资队伍，同时着眼于学科建设需要，择优引进归国人才，加强在职教师深造。
现本学科共有专任教师37人，其中教授（含研究员）14人，副教授13人，讲师7人，高级实验师1人、实验师2人，其中博士生导师8人、硕士生导师22人。专任教师中具有博士学位的21人，具有硕士学位的4人，具有博硕士学位教师占教师总数68%；本学科专任教师中有“新世纪百千万人才工程国家级人选” 1人，“国务院特殊津贴专家” 3人，“福建省高校新世纪优秀人才支持计划人选” 2人，“福建省百千万人才工程人选” 4人。
本学科拥有优良的科研和研究生培养条件，有省部共建国家重点实验室天然生物毒素工程实验室，蜂产品加工与应用教育部工程研究中心，福建省蜂产品加工工程技术研究中心，福建省农产品（果蔬）加工工程技术研究中心，国家农产品加工技术研发（蔬菜、水果）专业分中心、闽台农副产品加工与贮藏工程中央地方共建实验室、食品质量与安全中央地方共建实验室、农产品加工及贮藏工程福建省重点学科实验室、福建省高校食品科学与工程实验教学中心等科技创新平台，实验中心建筑面积约7000平方米，实验中心设备资产总值达到1900多万元，800元以上设备总台套数达到1179台套。
《国务院关于支持福建省加快建设海峡西岸经济区的若干意见》将发展农产品加工业以推进国民经济发展和改善民生置于突出地位。本学科围绕服务海峡西岸经济区建设和福建省食品产业需求，创制出一种以闽台合作为平台，以基础理论与技术集成创新为核心，以产业推进的产学研有机结合为重点，注重两岸交流合作培养研究生的特色发展模式。本学科在繁荣食品工业、促进高层次人才培养、推动海峡西岸经济区建设和两岸交流合作方面具有明显的优势和特色。
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