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湖南中医药大学基础医学院成立于1977年10月，原名基础课部，2004年更名为基础医学院，学院下设11个教研室、2个研究所、1个教学实验中心。主要承担全校中西医基础课程教学、实验教学和科研工作。学院现有教职工121人，其中专任教师99人，实验技术人员18人，行政管理4人。设5个博土点，6个硕土点，1个博土后流动站。有博土生导师7人，硕土生导师34人，先后培养博土50余人，硕土200余人。教师中有享受政府特殊津贴专家3人，湖南省名老中医2人，湖南省教学名师1人。
基础医学院师资力量雄厚，拥有一批国内知名专家、教授。其中教授18人，副教授 24人。省级、院级中青年骨干教师 10人，青年教师中有硕士学位以上者约64％。其中，中医诊断学为国家级重点学科；方剂学为省级优秀课程；中医基础理论为省级重点建设课程；医史文献和人体解剖学为院级重点建设课程。
基础医学院教学手段、实验设备先进，为了提高教学与科研质量，近年来总投资1500余万元购置教学与实验仪器设备，拥有数字图像分析系统、细胞融合仪、高密度扫描仪、核酸蛋白分析仪、微循环显微镜视频系统、基因检测分析系统等精密仪器。中医诊断研究所下属的“病理生理实验室”为国家三级科研实验室；分子生物学、病原免疫学、显微形态学等实验室为国家二级科研实验室。教学实验室的建设与开放为学生打下了扎实的理论基础，大大提高了学生的动手能力，巩固了教学成果。
基础医学院承担了学院本科生、研究生、留学生全部医学基础课程的教学，每年完成教学时数近4万余学时。近年来还先后承担了30余项各级教学改革研究课题，其中国家级教研教改课题1项，省级9项，院级20余项，获得各级教学成果奖20余项。编写教材60余部，其中主编13部，副主编17部，参编30余部，出版专著20余部。
基础医学院以中医诊断学为龙头，以高质量的科研队伍和先进的实验条件为依托，形成了浓厚的科研氛围，确定了技术平台并形成了稳定的研究方向。近五年来承担了各级科研课题70余项，其中国家级7项，省部级30余项，厅级50余项，近年来，基础医学院教师先后获各级科研成果奖80余项，其中国家级1项，省部级28项，厅级50余项。此外，基础医学院积极鼓励和支持教师进修和参加国内外学术活动，还多次组织学科年会和教材编审会。
基础课医学院现有博士点5个，硕士点6个，博士后流动站1个，已有2人进站。现有在读博士生28人（2004-2006），在读硕士生49人（2004-2006）。先后培养了博士50余人，硕士200余人，为国内外培养了一大批中医人才。
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