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2006年，食品经济管理专业获得教育部批准， 2006年，食品经济管理专业获得上海市教委重点学科食品经济管理建设（编号：J50703），2007年9月份，招收第一届学生，2009年，食品经济管理专业获得上海市教委食品经济管理专业课程体系与教材建设教育高地建设项目。
食品经济管理专业融合了食品科学、经济科学、管理科学、生物科学、政策科学等学科，跨越了食品原料加工业、食品机械制造业、食品制造业、食品运输配送业和各级政府食品质量安全管理监管部门，是跨产业、跨部门的多学科交叉型专业。在食品产品研发、食品安全战略、食品产业规划、食品冷藏链管理、食品物流信息化、食品品牌营销等领域形成了明显的学科专业特色。本专业从食品产业体系和价值链的角度进行食品经济管理专业人才培养，填补了上海和国内高校在该学科和专业领域的一个空白。
在专业设置上，坚持与行业发展相结合，以食品产业链和行业发展方向为专业发展道路。专业方向主要有：食品质量安全、食品产业发展、食品物流管理、现代食品企业管理等方向。
2010年12月，我校与上海申美饮料食品有限公司达成合作协议，共建“上海海洋大学可口可乐申美班”，“可口可乐申美班”生源主要来源于食品经济管理专业，积极探索人才培养新模式。
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