华中科技大学同济医学院基础医学院最早可以追溯到1907年德国医师埃里希•宝隆博士于上海建立的德文医学堂，从德文医学堂建立之初即有解剖学馆等8个基础医学相关学馆和生物科等5个公共基础科。1955年成立基础医学部，1993年5月25日基础医学部更名为基础医学院，到目前为止，拥有生理学系、神经生物学系、生物化学与分子生物学系、医学遗传学系、人体解剖学系、免疫学系、病原生物学系、病理学系、病理生理学系、药理学系共10个系和1个基础医学实验教学中心。涵盖在了基础医学、生物学、中西医结合、药学4个一级学科。1981年，病理学与病理生理学为第一批博士学位授权点，所有二级学科被批准为首批硕士学位授权点，随后其他学科也相继成为博士学位授权点。目前，基础医学、生物学和中西医结合均为一级学科博士学位授权点，药理学为二级博士学位授权点。

　　学院现有1个国家重点学科、2个国家重点（培育）学科、1个省级重点一级学科、1个省优势学科、1个国家级实验教学示范中心、1个教育部创新团队、1个教育部重点实验室、1个卫生部重点实验室、4个研究所、1个研究中心，已有5个重点学科获得了“985”建设支持。

　　学院现有教职工260人，其中千人计划入选者2人，长江学者特聘教授2人、讲座教授3人，国家杰出青年基金获得者3人，教育部“高校青年教师奖”获得者1人，教育部跨/新世纪优秀人才11人，楚天学者2人，国家教学名师2名。获教育部百篇优秀博士论文提名奖4人次。正副教授90人，其中二级教授9人、三级教授12人；博士学位二级学科授权点12个，博士生导师41人，硕士学位二级学科授权点13个，硕士生导师72人。全院共有学生二千多人，其中，博士生249余人、硕士生353人、本科生1600余人。建院以来共培养了数万名医药卫生领域优秀人才。

　　1978年以来以来，学院已通过鉴定的科研成果达116项，其中国际领先2项，国际先进44项，国内领先31项，国内先进33项，获各级科技进步奖、自然科学奖、发明奖共209项其中国家级奖励13项，部委级奖励60项，省级奖励67项，市级奖励26项，厅级奖励43项。仅2000－2005年学院主编的全国规划教材、面向21世纪教材、教育部国家“十五”、“十一五”规划教材27部，其中4部获全国高等学校优秀教材二等奖。承担省部级以上教学研究项目25项，1项成果获国家级教学成果奖，4项成果获省级教学成果奖。目前我院有3人担任全国学术团体副理事长以上职务，7人担任湖北省学术学会理事长职务，主编并公开发行的学术期刊2种。

　　改革开放以来，学院先后与美国、德国、荷兰、日本、澳大利亚、英国等多个国家和香港、台湾等地区院校、研究所、公司建立了友好关系，在教学、科研、人才培养等方面开展了广泛的合作与交流。

　　在长期的办学实践中，学院形成了“团结、严谨、求实、奋进”的院风和“同舟共济、自强不息”的同济精神，逐步形成了自身的特色和优势。

　　基础医学院计划招收直博生、硕博连读生的比例约为40%。