电子工程系位于清华大学东主楼，现有使用面积7760平方米。它的前身是1932年设立的电机工程系的电讯组，于1952年秋建系，始称无线电工程系，由清华大学、北京大学两校电机系电讯组合并而成。1956年改名为无线电电子学系。1970年系主体南迁四川绵阳，建立清华大学绵阳分校。1979年迁回北京，仍称无线电电子学系，1986年改名电子工程系至今。
电子工程系原有二个本科专业，即电子信息工程、电子科学与技术。从2005年起，为了适应学科的快速发展和宽口径培养的需要，这二个专业被合并为电子信息科学大类。本系每年招收本科生10个班，约300人。现设有6个博士和硕士点，每年招收博士生约80名，硕士生约170名，另外还在清华大学深圳研究生院招生。除全日制学生外，从1996年起，在企业、研究所和重点部门中招收工程硕士生。目前，我系在校本科生1020人，硕士研究生477人，博士研究生421人。我系现有电子科学与技术、信息与通信工程二个博士后流动站，在站博士后31人。
教书育人是学校的首要职责。电子工程系始终把提高教学质量、培养优秀人才放在首位，不断调整培养方案和教学计划，扩展专业领域，更新专业内容。开设了100余门本科生的专业基础课、专业课和研究生课程，涌现出一批教学质量高、深受同学爱戴的优秀教师，正式出版教材及专著百余部。近年来，我系不断组织教师对教学思想、教学内容和教学方法进行讨论，完善课程体系结构，着重专业背景下的通识教育的培养模式，提倡教师引导下学生主动学习的教学方法，加强设计型、研究型、实践型教学内容。
为了加强学生的数理基础，电子工程系加强了与我校物理系、数学系的合作，与数理基础科学班联合招生一个班约30人，旨在提升本科生的数理教学水平，探索现代基础教学的内容和方法。
在专业基础课程方面，电子工程系重点抓好系列课程的建设，即：信号与系统系列、电路技术系列、计算机系列、电磁场与微波系列及量子与半导体系列课程。随着网络技术的快速发展，2006年起增加了网络系列课程。为加强实验教学，电子系重点建设了现代通信教学实验室（包括高频、微波、通信）、电工电子实验基地和计算机教学实验室（包括软件、硬件）。这些实验室，除学校投入大量经费外，还接收国外著名企业（如安捷伦、泰克等）捐赠的高档仪器，为学生提供了当前国内外最高水平的实验条件。
电子工程系拥有三个国家重点实验室：微波与数字通信技术国家重点实验室、集成光电子学国家重点联合实验室清华大学实验区、智能技术与系统国家重点实验室智能图形图像分室。这些实验室在2002年全国评估时全部名列前茅。电子工程系还与国内外著名企业建立了多个联合实验室。全系现拥有仪器设备4138台，折合固定资产7057万元。
学科建设是一个大学、一个系赖以生存的基础。电子工程系始终坚持根据国家发展的需要、瞄准国际电子科学技术和电子工程领域发展的前沿不断调整、建设学科方向。目前电子工程系有二个一级学科，即信息与通信工程和电子科学与技术，在2006年全国一级学科评估中，全部名列第一。在2001-2002年国家重点学科评估中，我系五个二级学科中，通信与信息系统、物理电子学、信号与信息处理， 电路与系统四个二级学科被评为重点学科，微电子所的半导体器件与微电子学也被评为重点学科。
坚持教学和科研相结合、努力提高科研水平是研究型大学的特征。电子工程系积极投入各项国家级科技计划，努力提高科研水平。2006年，正在进行的国家项目120项，横向项目84项，国际合作项目87项。2006年科研经费为4831万。2006年获国家级奖励0项，获部委省市级奖励1项，专项奖励0项，授权专利44项。基础研究和交叉学科研究得到加强，2005年SCI收录论文123篇。
电子工程系现有6个研究所和教研组，分别是：信息光电子研究所、通信与微波研究所、高速信号处理和网络传输研究所、网络和人机语音通信研究所、图形图像研究所和电路与系统教研室。为了促进学科交叉、加强科研合作，电子工程系还成立了跨研究所、跨学科的光通信研究所、远程教育研究所等虚体所。以本系高技术成果转化形成的产业迅速发展，产生了清华阳光、清华华环、吉兆、紫光文通等公司及其他合办公司。
电子工程系的发展得益于一支优秀的老中青结合的教师队伍。目前形成的以中青年教师为骨干力量的教师队伍，秉承着我系勇于创业、团结协作、默默奉献、追求卓越的精神，形成了电子系的学风和优良传统。电子工程系现有教职工136名，其中二院院士2名，教授54名，副教授38名，博士生导师43名。
电子工程系采用引进和培养并重的方法，在提高青年学术骨干的全面素质等方面作了大量工作，努力创造事业留人的氛围。近年来，电子工程系从国外引进20多名优秀人才（其中百名人才1名），相继涌现出2名长江学者，1名讲座教授，4名杰出青年基金获得者；4名清华大学学术新人奖获得者；6名清华大学青年教师教学优秀奖获得者等，还涌现出“光纤通信研究所”、“多媒体通信课题组”和“智能图文信息处理研究室”等优秀青年教师群体。坚持了十多年的我系青年教师沙龙颇具特色，加强了青年学术骨干相互沟通、相互交流、相互学习、相互促进，有利于活跃学术气氛和促进人才的成长。他们已成为教学、科研第一线的骨干。目前我系45岁以下的青年教师有96人，占教师总数的70%，其中有博士学位的教师70名。
为适应学校发展和国家建设的需要，电子工程系把建设世界一流的电子科学与电子工程学科作为下一步发展的目标，努力改善学术环境、提高管理水平、建设科研平台、参与国际竞争，力争在不久的将来逐步跻身世界著名大学电子工程学科的前列。
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