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药学专业筹建于2000年，同年获批药理学硕士授权点，05年获批国家新药I 期临床研究机构，06年药理学获省精品课程， 08年被遴选为省级特色专业建设点，09年被批准成为安徽省生化药物工程技术研究中心。
10年来，药学系秉承学院“笃学精业、修德厚生”的校训精神，坚持“博学笃研、培智育才、勘药助医、立皖事国”的办学理念，以学科建设为龙头，师资队伍建设为关键，以培养崇尚知识、尊重科学，即具有理性的头脑又拥有探知未来世界知识和能力的药学创新型人才为己任，矢志不渝、百战不殆，为将其建设成为培养新世纪急需的复合型、创新型人才的摇篮而拼搏不止，已向社会成功输送药学本科毕业学生455名，学术型硕士研究生41名，连续5年获本科生、研究生毕业当年就业100%。在校学生中多次获得“省先进班集体”、“省大中学生志愿者暑期三下乡社会实践活动先进集体”光荣称号，以及多人获国家级、省级、院级先进个人表彰。
药学专业现拥有一个由药理学、药物化学、药剂学、药物分析、中医药基础等5个教研室，1个药学实验中心和1个学生管理办公室构成的组织化构和一支结构健全、学风过硬的学术团队，全团队成员共34名，其中教授、副教授20名，高职比占59%；博士12名，硕士17名，硕博比85.3%。34名成员分别来源23所院校，校外学缘占80%。全国优秀教师、省模范教师、省教学名师、省高校学术带头人、省德育先进工作者、省教育系统巾帼建功标兵、省教坛新秀、省高校毕业生就业先进工作者、学院教学名师和骨干教师等占整个教师队伍的35%。
药学专业拥有教学、科研用房各近2000m2，HPLC /LCQ-advantage MAX液质联用仪、日本岛津LC-10AT高效液相色谱仪、GC-2014气相色谱、Powerlab生理信号采集系统、细胞层流室、药学虚拟实验室等价值约800万元的现代化设备并共享学院科研中心、众多的多媒体教室及学院千兆校园网络系统、12大检索期刊源和114.6万册馆藏图书的图文信息中心。承担国家级、省级、院级教学和科研课题及横向课题共160余项，发表教学科研学术论文共200篇，主、参编规划和协编教材及教学参考书、专著20余部。
十年创业路，猛回首，数劳辛辛如故，百年传薪途，放眼观，见路长长亦然。 药学系将一如继往地以科学发展观为指导，竭尽全力，努力办好人民满意的药学教育，为培养高质量应用型医药卫生人才作出更大的贡献！
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