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本硕士点设在工程学院，授予工学硕士学位。
机械制造及其自动化是一门研究机械制造理论、制造技术、制造模式、制造过程自动化和制造过程信息化的学科。本学科面向海洋装备、水产品加工和热带农作物生产加工等领域，机、电、信息等多学科交叉融合，以机械制造及其自动化的理论、方法和技术为研究对象，运用现代信息技术、计算机控制技术、计算机网络技术、机电一体化技术和先进制造技术等方法和手段，解决相关行业的技术难题，提供科研服务。本专业下设以下3个研究方向：
1、数字化设计与制造技术
运用现代数字化设计技术及先进制造技术服务于石油、钢铁、港口、家电等行业，解决海洋装备制造与腐蚀监控、水产品养殖与加工设备、机械加工制造及新产品研发等教学、科研和生产中急需解决的科学和技术难题，着力提高制造业的信息化程度。
2、现代生物生产装备及其自动化
主要从事水产品加工设备和热带农业装备及自动化方面的研究，致力于实现水产品和热带农作物生产加工的机械化、现代化。
3、节能设计与动力设备
主要从事光机电产品的节能设计、热工设备和动力设备的节能性能研究。将先进制造技术和热科学技术理论结合，从节能角度提高产品或设备在制造和使用过程中的效率。
本学科2006年获得硕士学位授予权。现有教授和研究员8名，副教授和副研究员20名，其中具有博士学位者11人。现有硕士研究生导师17人（包括中国热带农业科学院农业机械研究所兼职导师4人）。目前承担国家自然科学基金项目4项，承担科技部、农业部和省市级项目等10余项。拥有1个广东省实验教学示范中心，实验仪器、设备总价值超千万元。为本学科培养研究生构筑了良好的基地，为高水平的科学研究和人才培养提供了条件和保障。
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