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上海海洋大学工程学院是在我校1956年设立的渔业机械专业的基础上发展而成的传统特色学院，于2006年1月18日正式成立。
工程学院拥有一支结构合理、年富力强、学术思想活跃、综合素质好的优秀学术队伍。具有高级职称的教师23人，博士生导师2人，硕士生导师12人；有博士学位的30人。现有有机械设计制造及其自动化、工业工程、电气工程及其自动化、物流工程四个本科专业，拥有“机械工程”一级学科硕士点（涵盖机械设计及理论、机械制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程四个二级学科硕士点），和“机械工程”工程硕士授予权。与美国佛罗里达理工学院和澳大利亚库克大学实行2+2的本科和3.5+1.5的硕士生联合培养的办学模式。拥有海洋工程研究所、渔业节能研究所、机电工程中心和大学生科技活动中心。聘请西安交通大学、西门子中国有限公司、日本国立三重大学、日照市港务局、上海集浪能源科技有限公司多位专家作为学院的兼职教授。拥有农业部颁发的渔业船舶设计丙级证书；拥有AutoCAD、SolidWorks、ADAMS等现代设计与系统动态仿真软件，具有提供CAD、UG、SolidWorks、数控资质等培训与认证。
学院具有较强的科研实力，拥有较宽的研究领域和良好的科研基础，主要研究方向涉及海洋工程装备、海洋新能源、现代农业和渔业装备及相关控制技术、食品加工机械、电子与电气工程技术等。目前承担的主要项目包括：国家自然基金、国家海洋局海洋新能源专项、上海市科委、教委科研创新项目等。学院与农业部、国家海洋局、中海油、上海电气、日照港集团公司等部门和企业保持着长期的科研及人才培养合作。
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