中国科学院青岛生物能源与过程研究所由中国科学院、山东省人民政府、青岛市人民政府于2006年7月开始共同筹建，系中国科学院直属科研机构，并纳入中国科学院“知识创新工程”管理系列，专门从事生物能源与过程领域研究，重点面向国家能源、资源与环境等重大战略需求，面向国际生物加工与转化科技前沿，紧密结合地方经济社会发展需要，开展生物能源与过程领域基础性、战略性和前瞻性研究。
研究所筹建初期的领域定位是：基于生物资源，以工业生物技术、物化转化技术为主要手段，以战略高技术研发为主要任务，研究开发生物基能源、生物基材料的产品、工艺或技术，服务于国家和地方在资源开发、能源利用、清洁过程等领域的需求。
研究所下一步的发展方向是：组建“中国科学院能源科学与技术中心”，科研项目聚焦于生物资源、生物催化与转化、生物燃料、生物基化学品、生物医药、生物基材料、节能技术、储能技术、非碳能源、清洁过程等十大优先研究领域。
研究所规划至2010年组建18个科研团队，人员规模达到500人，其中创新岗位人员150人，项目聘用岗位人员150人，研究生150人，博士后、客座研究员和兼职人员50人。
建所理念
为适应中国科学院知识创新工程三期的基地建设要求，研究所以现代管理理念为指导，吸收国内外科研院所、企业各类创新管理模式经验，兼容并蓄，建设以“管理模块”、“科研模块”和“支撑模块”为主要构成的平台化管理运作模式。
建所目标
着力将研究所建设成为以产业科技需求、战略目标规划为导向，以“支撑系统平台化、科研组织规模化、人力资源动态化、面向应用价值化”为核心，以制度体系建设为保障，以过程管理为主线，以绩效评价为手段的规范、协调、灵活、高效的现代化研究所。
基本建设概况
研究所园区总占地面积7.31公顷（约110亩），一期工程总建筑面积34000平方米。
主要建设内容包括1#科研办公楼，总建筑面积20237平方米，其中生物实验楼7440平方米、化学实验楼6303平方米、科研办公楼6494平方米；2#研究生宿舍楼，建筑面积4916平方米；3#专家公寓楼，建筑面积3481平方米；4#专家公寓楼，建筑面积3095 平方米；5#中试车间，建筑面积1711 平方米；其它附属配套用房，建筑面积560 平方米。
人才队伍概况
截止2009年3月底，研究所全职职工为183人，其中管理人员18人，占总人数的10%；科研人员134人，占总人数的73%；支撑人员31人，占总人数17%；硕士及以上学历人员占87%，年龄35岁以下人员占85%，全所人员平均年龄为29.9岁。已经招收在学研究生58人，聘任客座流动人员18人，全所总人数达到259人。在科研和支撑岗位人员中具有高级技术专业职务人员36人，其中9人为中国科学院“百人计划”入选者，1人为山东省“泰山学者”。已经形成了一支结构合理，年轻化、专业化的人才队伍。
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