中国农业科学院甜菜研究所始建于1959年，是农业部直属专业科研机构。2003年与黑龙江大学合并，实行黑龙江省政府与中国农科院共建。该所位于哈尔滨市呼兰县火车站附近，所区占地面积81公顷，全所在职职工180余人，实验办公楼面积1万余平方米，固定资产3100余万元。
全所设有遗传改良、环境资源、遗传资源和引种区试四个研究室。国家糖料作物改良中心、中国农业科学院黑龙江科技示范基地和农业部甜菜质量监督检验测试中心挂靠在该所。
中国农业科学院甜菜研究所经几代科技人员的辛勤耕耘和努力奋斗，在科学研究、产业开发、基础设施建设等方面均取得了显著的成绩和长足的进步，已成为国家甜菜科技创新和学术交流中心。现在有科技人员近80人.其中研究员10人，副研究员18人，助研42人，硕士生6人。目前主持和承担国家及省级各类研究项目28项。获得科研成果一百余项，其中省部级以上获奖成果31项。育成并审定命名甜研系列品种28个，其中，多倍体品种甜研301获国家发明二等奖，甜研302、303、304获国家科技进步三等奖。
建所以来，与德国、美国、英国、日本、波兰、法国、乌克兰、俄罗斯、荷兰、意大利、丹麦等国进行了互访考察和学术交流，并开展了合作研究。参加了世界Beta属种质资源协作网等国际甜菜协作组织的活动。于1994年在北京主持举办了首届国际甜菜学术会议。编辑出版的中国糖料杂志在国内外公开发行，已成为甜菜研究与学术交流的核心期刊。
全所有试验耕地54公顷并全部配有喷灌设施和围墙保护，调温调湿母根窖和低温库近700平方米，2栋温室、5栋网室、中期和短期种质资源保存库、春化室及中心实验室。中心实验室下设生物技术、抗病育种、植物营养、虫草、生理及品质检测等9个实验室，拥有万元以上仪器设备近200套，小区播种机及小份育种材料烘干、脱粒、清选等专用设备10余台件。
在产业开发方面，经不断完善和调整形成了以经营甜菜种子为主体的开发体系。目前所育甜菜品种已成为我国甜菜产区的主栽品种，推广面积占全国甜菜种植面积60%。该所建立了种子加工车间，种子储藏库及种子繁育基地等。甜菜纸筒育苗肥、水稻壮秧剂、植物生长调节剂等已进行了企业产品执行标准注册，进入市场。除甜菜之外，在马铃薯、亚麻等作物上也开展了开发性研究，建立了马铃薯脱毒种薯快繁技术体系及与之相应的原种基地和生产种基地。同时开展了亚麻良种的繁育工作。ˇ
中国农业科学院甜菜研究所重视精神文明建设和职工素质教育，现已被命名为黑龙江省精神文明单位和中国农业科学院精神文明单位。
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