中国农业科学院郑州果树研究所成立于1960年3月，占地45公顷，其中试验用地38公顷。在职职工209人，其中科技干部170人，具有高级专业技术职务者60人，中级专业技术职务73人，获得博士、硕士学位者62人。院杰出岗位人才8人，中国农科院研究生院在我所设有博士、硕士培养点。先后两次被评为中国农科院文明单位，先后获得市级文明、文明标兵和省级文明单位，荣获河南省“十佳绿化”先进单位等称号。
研究所面向我国中部地区的生态环境，长期从事落叶果树（苹果、梨、葡萄、桃、猕猴桃、樱桃、李、杏、草莓等）、西甜瓜的品种资源收集、保存、评价、优良品种选育、栽培技术、病虫害综合防治、果品贮藏与加工等方面研究和推广工作。以应用研究为主，有重点的开展基础研究，参与国际交流与合作，服务社会，服务于广大果农。获得各级各类科技成果170余项，其中获得国家科技奖9项，省部级科技奖励成果61项；培育并审定果树瓜类新品种100多个（其中，1998-2008年期间审定果树瓜类新品种61个）。研制推广新产品10多个，取得国家发明专利5项，形成了一批具有自主知识产权的技术和产品，在生产中推广并产生了巨大的经济效益和社会效益。
研究所设8个专业研究机构，在此基础上，形成了果树瓜类种质资源、果树瓜类遗传育种、果树瓜类生理栽培、果品质量安全控制、果品贮藏加工五大学科，围绕五大学科，开展研究和技术推广工作。建立了3个科技型企业，设置了3个管理机构。国家果树种质资源郑州桃圃、葡萄圃、国家西甜瓜中期工作库、农业部果品及苗木质量监督检验测试中心（郑州）、国家葡萄、桃改良中心、国家落叶果树良种繁育基地、农业部瓜果脱毒种苗成果转化基地均建在我所。主办《果树学报》、《中国瓜菜》、《果农之友》和《中外果树栽培技术精选》四份科技期刊。中国园艺学会西甜瓜专业委员会、中国园艺学会桃分会和全国西甜瓜协会挂靠在本研究所。在不断研究发展中，研究所已具有较强的研究实力和技术创新能力，在农业部组织的“十五”全国农业科研机构综合科研能力评估中，在参评的1077个农业科研机构中总排名第90名。
根据“科研立所、产业兴所、管理稳所”的指导思想，研究将优化科技资源配置，保持持续的科技创新能力，建立多种产业开发体系，保持稳定的经济收入来源。将研究所建成国内领先的果树瓜类科技创新基地、国内一流的果树瓜类成果转化基地，国内知名的果树瓜类信息交流人才培训基地。为提高我国果树的自主创新能力，为增加农民收入和社会主义新农村建设而做出更大的贡献。
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