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中医骨伤科学专业于1998年获得硕士学位授予点，其建设依托学院第一附属医院骨伤科。本学科为国家（中药）新药药理基地，为安徽省中医药学会骨伤科专业委员会挂靠单位。现有主任医师（含教授）5人，副主任医师（含副教授）3人，主治医师4人，其中在读博士1人，硕士3人。导师组积极开展医疗、教学、科研工作，支持学院成立了骨伤科专业（本科），并承担其临床理论及部分临床教学任务。
主要研究方向：①中医药促进骨折愈合的临床与实验研究；②中医药防治软组织损伤的临床与实验研究；③中医药防治颈肩、腰腿疼痛的临床与实验研究；④手骨显微外科；⑤小儿骨科；⑥脊柱脊髓病的研究；⑦手部创伤的研究；⑧骨关节疾病的研究；⑨创伤整复研究。学科研究重点为骨伤科疾病手法治疗的临床和实验研究，骨折、脱位、伤筋、内伤、骨病、药物治疗的临床和实验研究。目前以骨伤科常见、疑难疾病为主攻方向，如股骨头缺血性坏死、颈椎病、骨性关节炎、骨质疏松症的临床和实验研究。
本学科目前主要承担参与省“十五”攻关课题：老年骨质疏松中医证候学与临床诊断标准的研究；省教委课题：中西医结合治疗股骨头缺血坏死的临床研究等多项科研课题。近年来本学科多次参与骨伤科系列教材的编写（副主编），在国家级杂志公开发表论文、论著50余篇，参编主编本专业相关著作20多部。研制了接骨消瘀散、颈椎活血胶囊、骨疽拔毒散、骨炎灵散等院内制剂，效果良好，有的已申请为国家新药。
本学科聘请山东文登整骨医院谭远超、丛海波等享受国务院特殊津贴的骨伤科中青年专家，以及河南洛阳正骨医院的骨伤科专家作为兼职硕士研究生导师，并与这两家医院结成联合培养单位，为研究生临床工作能力的培养创造了有利条件。
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