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测绘工程系建于2006年，其前身是测量教研室。测量教研室于1958年建校初期创建。
测绘工程系现有专职教职工14人，其中教授3人，副教授2人，高级工程师2人，讲师5人，工程师1人。师资学历结构：博士学位1名、在读博士学位1名，硕士学位8名，硕士及以上学位占教师总数的69.2%。师资专业结构：测绘工程、摄影测量与遥感、地理信息系统和测绘仪器等。师资队伍的职称、学历、年龄结构合理，发展趋势良好。该系全面负责土木工程学院测绘工程专业的教学及科研工作。
测绘工程系承担着测绘工程、土木工程、工程管理、水利水电工程、地理信息系统、城市规划、给水排水工程、环境工程、建筑环境与设备工程、交通工程、交通运输、物流管理等12个专业相关课程的理论教学及实验教学任务。2005年工程测量课程被遴选为甘肃省精品课程。
测绘工程系下设工程测量实验室。实验用房面积660m2，固定资产总值约404万元。其中，全站仪、静态GPS接收机、动态RTK接收机、数字水准仪、数字摄影立体观测系统等现代测绘仪器设备有50多台套。这些仪器设备对促进专业建设、测量课程创新实验教学起到了至关重要的作用，使学生提高了运用现代测量技术解决工程实际问题的能力。此外，测绘工程系依托中国人民解放军68011部队、中铁一院集团甘肃勘察院、甘肃省测绘工程院、兰州市测绘研究院等军地单位建立了相应的校外测量实习基地，为专业实习提供了有力的保障。
2005年招收首届测绘工程专业本科生。该专业是以“3S”技术理论与应用研究为中心，培养和造就国民经济建设和国防建设中需要的基础扎实、适应性强、有实践能力和创新精神的应用型高级专门人才。专业主干课程：测量学、控制测量学、测量平差、工程测量学、摄影测量与遥感（RS）、全球定位系统（GPS）原理与应用、地理信息系统（GIS）原理与应用。毕业生能在国民经济和国防建设各部门从事国家基础测绘建设，在各类工程建设、城市规划和建设、矿产资源勘察与开发、国土资源调查与管理、环境保护与灾害预防及地球动力学等领域，从事测绘工程设计、地图与地理信息系统的设计、实施、研究、管理及教学等方面工作。
测绘工程系以学科建设为龙头，教学、科研及生产相互依存，相互促进，共同推进测绘工程专业的健康发展。近3年来发表科研论文40余篇，教改论文5篇，获省部级科技进步三等奖1项，地厅科技进步奖2项，获省教委奖1项，获校级教学成果二等奖1项， 2003年以来共出版教材5部。
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