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医学技术系成立于2004年，2001年开设医学检验本科专业，2002年开设医学影像学本科专业，2004年开设中西医结合口腔医学技术高职专业。医学检验、医学影像学是陕西省唯一的医学检验、医学影像学本科专业。目前在校生561名，其中本科生395名，高职生166名，研究生12名。
医学技术系现有专兼职教师48人，其中教授9人，副教授9人，讲师10人，医学硕士10人，在读博士2人，在读硕士11人。硕士研究生导师8名。享受政府特殊津贴专家1人。
医学技术系设有系党政办公室；临床检验学教研室、免疫及检验学教研室、病原微生物及检验教研室、医学影像诊断教研室、医学影像技术教研室、口腔医学教研室及医用物理学等七个教研室；设有医学检验学实验中心、医学影像学实验中心及口腔医学等三个实验中心；并在陕西中医学院附属医院设有医学检验临床实验实训中心、医学影像学临床实验实训中及口腔医学等三个临床实验实训中心。医学技术系以陕西中医学院附属医院检验中心、影像中心、口腔科为依托，进行教学、科研和学科建设，承担硕士研究生、本科生、高职等不同层次31门基础课、专业课程的教学工作。
医学检验学实验中心设有数码显微互动实验室、微生物学检验实验室、免疫学检验实验室，面积500多平方米，实验仪器总价值200多万元。可满足医学检验专业及全院学生实验技能训练需要。数码互动实验室配备有64套数码显微镜、学生电脑及教师电脑，并有投影仪等多媒体教学仪器设备，处于国内先进水平，为医学检验、微生物学、寄生虫学及形态学实验教学创造了良好的条件。
医学影像学实验中心设有医用物理学实验室、电子学实验室及医学影像学模拟教学实验室，实验室面积200多平方米，实验仪器总价值100多万元。可满足医学影像学专业及全院学生医用物理学、医用电子学实验技能训练需要。
医学技术系有陕西中医学院附属医院、陕西省人民医院、西安交通大学第二医院、西安市中心医院、西安市第一医院、西安市铁路中心医院等教学医院，承担临床教学和见习、实习任务。
中西医结合（基础）免疫学专业是国内较早的硕士学位授权单位之一。20年多来共培养中西医结合（基础）免疫学专业硕士研究生30余人，有6人考取博士。毕业生中大多数已成为事业有成的管理、业务、科研骨干。
医学技术系近年来承担国家级、省部级、厅局级课题13项，曾获省部级奖12项，国家、省部级科技成果奖23项。出版著作6部，发表论文20多篇。免疫学为院级重点学科、精品课程。
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