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应用数学研究所成立于2001年，主要致力于具有实际背景的数学基础理论研究，发展和创造在自然科学、经济金融和现代控制等领域中有普遍意义的数学理论和方法，为国民经济建设服务。
应用数学研究所现有科研人员10人，其中教授3人，省杰出青年基金获得者1人，具有博士学位人员8人。经过多年的发展，应用数学研究所目前已形成了以常微分方程和控制理论为特色的研究方向，在省属高校中具有一定的优势。特别是在常微分方程定性理论研究和复杂系统控制方面，取得了若干创新性研究成果，引起了国内外同行的关注，科研成果被广泛引用。
多年来，我所科研人员以勤奋、严谨和创新的精神从事科学研究，取得了丰硕的科研成果。建所以来，已被SCI收录论文100余篇；主持和参与国家自然科学基8项，省杰出青年基金1项，省自然科学基金多项；获得省自然科学二等奖和三等奖各一项，省高校优秀科研成果奖若干项；指导硕士研究生多人，研究生被SCI收录论文20余篇，其中一人获得研究生创新成果三等奖。
应用数学研究所广泛开展与国内外相关领域专家学者的交流合作，充分调动和挖掘青年教师的科研积极性和潜力，发挥团队优势，强化特色优势研究方向，全力提升济南大学应用数学专业的知名度。通过3-5年的建设，打造一支在国内有一定影响的高水平科研团队，在国家级项目、高水平论文和省部级以上奖励方面有所突破，为成功申报数学学科博士点做出重要贡献。
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