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黑龙江省科学院前身始建于1958年的中国科学院黑龙江分院。黑龙江省科学院是省政府直接领导的厅级科技事业单位、省自然科学与技术科学综合性研究中心。主要职责是管理自然科学和技术科学的研究院所、中心，组织协调有关单位开展科学技术活动，参与省科技发展规划的制定，授权委托联系中国科学院、中国工程院事宜，开展国际学术交流与科技合作。科技实力和创新水平目前居全国省（市、区）科学院的前列。
省科学院由高技术研究院、石油化学研究院、大庆分院、微生物研究所、技术物理研究所、自动化研究所、自然与生态研究所、火山与矿泉研究所、亚麻综合利用研究所、院研究生部、省对俄工业技术合作中心、院生物肥料研究中心、院科技孵化中心、院科技企业组成，代管中科院东北地理与农业生态研究所，为省化学、生物工程、微生物、自动化等6个学会的主办单位，出版发行《化学与粘合》、《自动化技术与应用》、《国土与自然资源研究》、《生物技术》等科技期刊。
省科学院主要从事应用基础、战略高技术和重点公益的研究，基础性研究占20%，应用研究占30%，开发研究占50%，国际合作、国家重点、省部级公关项目始终占在研项目的50%，先后取得1000多项科技成果，获得11项国家科技发明和科技进步奖。现有两个国家级博士后研究工作站，上百名国家级有突出贡献专家、省级学科带头人、享受政府特贴专家，一个国家级检测中心，13个省部级重点实验室、中试基地、工程中心、12个专业研究居国内领先或先进水平。
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