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动物科学技术学院是吉林农业大学历史最悠久的主干院系之一，是全国首批硕士学位授权单位。学院现设有动物科学、动物医学、水产养殖学3个系和1个专业基础教研部。有预防兽医学和动物营养与饲料科学2个博士学位授权学科；有预防兽医学、动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖科学、临床兽医学、基础兽医学、草业科学6个硕士学位授权学科；有动物医学、动物科学、水产养殖学、畜禽生产教育4个本科专业和畜牧兽医1个专科专业；并在兽医、养殖、预防兽医学、动物营养与饲料科学等4个领域培养在职研究生。
学院师资力量雄厚，现有教授17人、副教授27人，其中国务院津贴享受者3人、国家百千万人才工程人选1人、吉林省高级专家2人、吉林省有突出贡献的中青年专家 2人、吉林省拔尖创新人才 2 人、吉林省杰出青年3人；有国家百千万人才工程人选、吉林省畜牧兽医学会理事长、吉林省有突出贡献的专家、吉林省拔尖创新人才、吉林省优秀教师、博士生导师秦贵信教授，国家级优秀教师、吉林省教学名师、博士生导师何昭阳教授，吉林省首席教授、博士生导师钱爱东教授等著名专家和学者。有博士和硕士生导师40余人，专任教师中具有博士学位的教师占50%以上，具有硕士学位的教师占80%以上。学院现有在籍本、专科生1365人，博士、硕士研究生300余人，在职攻读硕士学位研究生60余人。
学院设有农业部和吉林省重点学科——预防兽医学、吉林省重点学科——动物营养与饲料科学、吉林省一级实验室——预防兽医学实验室，以及动物营养、动物繁育、基础兽医、临床兽医、水产养殖等实验室，拥有完善的教学科研设施和先进的仪器设备。在科研上，主持国家级、省部级和地厅级课题多项，并有多项成果获奖。
学院设有国家囊虫病防治技术研究与推广中心、吉林省畜牧业研究开发中心、长春市鹅业研发中心、中兽医研究所和国家优良品种鹅基地、兽医院、综合动物养殖场等教学和科研机构，有校外实践教学基地29个。
学院拥有《预防兽医学》、《动物营养学》、《动物育种学》、《动物药理学》、《动物繁殖学》、《动物组织与胚胎学》、《动物解剖学》、《生物统计学》和《鱼类学》等九门国家级、省级、校级精品课程与优秀课程。
多年来，学院十分重视国际交流与合作，先后与日本、韩国、加拿大、意大利、美国等国家的多所大学和科研机构建立了友好协作关系。学院每年都邀请国外专家和学者来院讲学，并选派部分教师和学生出国攻读学位与合作研究，提高了学院的办学实力和知名度。
为满足市场对人才培养的需求，学院与东北三省及华北部分地区的20余个企、事业单位建立了联合办学董事会，现已形成了教学、科研、产业一体化的综合性学院。
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