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福州大学数学与计算机科学学院的前身为福州大学数学力学系，成立于1958年。1962年改名数学系。1977年设置应用数学、计算数学、计算机软件、计算机技术专业。1984年分为数学系、计算机科学与技术系。2003年6月，为坚持理工结合的办学特色，促进基础学科和应用学科互动发展，两系合并成立了数学与计算机科学学院。
学院现有应用数学二级学科博士点，数学和计算机科学与技术两个一级学科硕士点及软件工程、计算机技术两个工程硕士点，应用数学专业高校教师在职攻读硕士点；数学与应用数学、信息与计算科学、计算机科学与技术、网络工程、信息安全、软件工程等六个本科专业；现有离散数学及其应用教育部重点实验室、福建省科学工程计算重点实验室、福建省超级计算中心以及四个校级研究机构（数学研究所、计算机应用技术研究所、计算机软件研究所、龙网信息安全技术研发中心）；建校以来，已为国家输送大量专业人才。现在中国科学院软件研究所工作的林惠民院士以及林作铨、林方真和刘旭等国内外知名的学者，就是我院校友的杰出代表。目前，全院在校本科生2570名，硕士研究生337名，工程硕士生508名。
学院十分重视学科的建设并取得了明显的成效。现有计算机科学与技术省级特色专业，应用数学、计算机应用技术两个省级重点学科，其中计算机应用技术是福州大学“211工程”二期重点建设学科方向之一，离散数学及其应用是福州大学“211工程”三期重点建设学科，两学科经过长期的积累，已经形成了多个有特色、有优势的学术研究方向，在相关应用基础理论研究和实际应用方面都取得了突出的成果。
学院坚持面向经济建设主战场，科研成果丰硕。学院近年来，主持承担了国家973计划、国家自然科学基金等国家级重大项目27项，教育部重点项目7项，福建省自然科学基金、福建省发改委项目和福建省科技重点项目58项、福建省教育厅项目69项；获国家自然科学二等奖1项；获教育部科技进步一等奖1项，获省部级科技成果奖励8项；获福建省运盛青年科技奖1人；获国家级教学成果二等奖1项，获省部级优秀教学成果5项，其中1项特等奖，2项一等奖，2项二等奖。
学院拥有一支实力较强的师资队伍。在180名专任教师、专职科研人员中有正、副教授77人，国家级专家2人，省优秀专家3人，省教学名师2人，入选省“百千万人才工程”人选3人，入选省高等学校新世纪优秀人才7人，省属高校优秀中青年骨干教师2人，全院共有校聘关键岗21人。学院现任党委书记肖赞强，院长常安教授。
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