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中国科学院昆明分院前身是中国科学院成立于1957年的中国科学院昆明办事处,1958年扩建为中国科学院云南分院,1962年,中国科学院云南分院与四川分院、贵州分院合并,共同在成都成立中国科学院西南分院。1978年10月,经国务院批准,西南分院撤销,成立中国科学院昆明分院。
昆明分院作为中国科学院机关的派出机构,负责联络和协调中国科学院在云南和贵州地区的昆明植物研究所、昆明动物研究所、西双版纳热带植物园、地球化学研究所、国家天文台云南天文台等五个科研单位。昆明分院系统共有在职职工1553人。其中科技人员1121人、科技支撑人员287人,包括中国科学院院士6人、第三世界科学院院士1人、研究员及正高级工程技术人员164人、副研究员及高级工程技术人员231人,中国科学院“百人计划”入选者59人、国家杰出青年科学基金获得者21人、进入创新岗位人员共有761人。建有4个国家重点实验室,2个院重点实验室,5个院地共建重点实验室,2个院级研究中心,3个共建工程中心,5个博士点,5个博士后流动站。
重大科研平台有“中国西南野生生物种质资源库”、探月工程地面应用系统40米射电望远镜、亚洲最大2.4米天文望远镜、西双版纳万种植物园和昆明动物博物馆;在建工程有西南多样性生物实验室;拥有一批先进的大型科研仪器设备和完善的计算机网络系统及生物多样性信息系统。
昆明分院机关由综合办公室、科技合作处、组织人事处、资产财务管理办公室4个职能部门和网络中心组成,主要职能是负责院属五个研究单位的领导班子和后备干部队伍建设;负责组织和促进中国科学院与云贵两省的联系和合作;协调中科院研究所与地方展开院地科技合作;做好综合协调工作,为研究所服务;协调国际科技合作的相关工作,搭建与东南亚国家的合作交流平台。
 

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