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石河子大学机械电气工程学院具有悠久的办学历史，其前身为1959年成立的中国人民解放军新疆生产建设兵团农学院农业机械化系。1996年9月石河子大学成立后更名为石河子大学工学院机械电气工程系。2001年成立机械电气工程学院。
目前学院设有4个系、3个办公室、3个实验中心、1个图书资料室和1 个CAD中心。拥有国家教育部工程中心1个；省重点实验室1个、检验测试中心1个、职业技能鉴定站1个；省级重点学科1个、精品课程2门；校级重点学科1个、特色专业1个、品牌专业1个、精品课程3门、一类课程6门；一级学科硕士学位点1个，二级学科硕士学位点3个；农业工程与农业推广专业硕士点2个；农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、电气工程及其自动化与工业工程4个本科专业；并设有成人教育及高等职业教育，形成了研究生教育、本科生教育、高职教育等多层次多形式的办学格局。
学院现有师生1515人，其中教工89人，硕士生导师21人，教授11人，副教授28人,博士9人，硕士60人，省部级教学名师1人，校“263”骨干教师18人。在校本科生1375人，研究生53人。
学院自建院以来，始终坚持以培养基础扎实、作风严谨、具有较强创新能力的高素质人才为目标，以服务区域经济建设、服务社会的办学理念为目的，在学科建设、科学研究、教学教改、人才培养以及对外交流等方面取得了一定的成果。近年来，获科研项目95项，其中国家级17项，省部级16项，自治区及兵团项目20项，校级项目近50项；获省部级科技进步奖6项。获批国家实用新型专利40余项；在全国大学生科技竞赛中获奖励多项。此外，学院还不断优化办学资源，以学院实验中心为平台，拓展区域型高水平工科学院的社会服务功能，先后与国内外高校及企业建立了良好的交流与合作关系。目前学院正以“211工程”建设为契机，依据大学“新跨越发展计划”的要求，抓住机遇，开拓创新，力争建成一个特色鲜明、西北一流、学科特色鲜明的区域型高水平工科学院。
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