农学院前身是原哲里木畜牧学院草原系，始建于1978年12月。1996年1月草原系一分为二，建立了农学系和草原系。2000年10月内蒙古民族大学成立之际，农学系、草原系合并组建农学院。
      农学院现有作物栽培学与耕作学、草业科学2个硕士学位学科点和农学、草业科学、植物保护、农业资源与环境、园林、园艺6个本科专业。其中，作物栽培学与耕作学学科为内蒙古自治区重点培育学科，草业科学学科为内蒙古民族大学重点学科，农学专业为自治区品牌专业；植物生产类实验中心为自治区级实验教学示范中心；《土壤肥料学》、《植物生理学》为自治区级精品课程。现有在读硕士研究生33人，本科生1175人。
      经过多年的引进和培养，农学院拥有一支学历层次高、学科结构合理，能胜任本科生、研究生教育的师资队伍。现有教职工56人，其中教授8人、副教授10人。师资队伍中有10人具有博士，18人具有硕士学位人员；1人获自治区深入生产一线做出突出贡献科技人员称号，3人获自治区优秀教师称号。学院先后取得科研成果30余项，其中15项成果获市级以上奖励。目前承担各类科研课题20余项。
      二十多年来，累计为社会培养本科生3000多人，向国内外农业院校与科研院所输送研究生526人，他们成为我国特别是内蒙古自治区农业生产、科学研究、教育管理等部门的重要力量。农学院是我校研究生升学率最高的学院之一。近年来，农学、草学、农业资源与环境研究生升学率在50％左右。
      学院拥有植物光合测定系统、叶面积仪、稳态气孔计、GPS基准站与流动站、全站仪、高速冷冻离心机、超低温冰箱、基因扩增仪、凝胶电泳成像系统、微机BOD测定仪、移动式昆虫标本柜、光密度扫描仪、电视生物显微镜、半自动蛋白质测定仪、半自动粗纤维测定仪等一批先进的仪器设备。
      农学院设有作物、草业科学、植物保护、农业资源与环境、园林和园艺6个教研室，设有作物、草业科学、植物保护、园艺、农业资源与环境、园林、植物基础和环境基础8个一级实验室和21个二级实验室。其中，植物基础、环境基础2个实验室为自治区合格实验室。此外，农学院还设有作物研究所、草业研究所和校内农业科学实验站。