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湖南中医药大学药学院前身为湖南中医学院中药系，始创于1975年，1992年迁至井湾子校区，命名为药学分院，1999年更名为药学院，2006年由井湾子校区搬迁至含浦新校区。
药学院下设3个行政科室、13个教研室、2个教学实验中心、1个中药标本馆以及药植园。现有教职工107人，其中教授22人、副教授26人，中级职称34人，71%的教师具有硕士以上学位，博士生导师7人，硕士生导师46人。目前在校博士生、硕士生223人，在校本科生2204人。
药学院现有学士、硕士两个办学层次，设有中药学、药学、药物制剂、生物工程、制药工程、中药资源与开发、食品科学与工程等7个本科专业，其中中药学专业为湖南省高校重点专业、特色专业以及教育部普通高校特色专业，药学专业为湖南省高校“十一五”重点建设专业和特色专业，药物制剂学为湖南省特色专业；中药学为湖南省重点学科，中药制剂学和药用植物学为国家中医药管理局重点学科。同时拥有中药学、药物化学和中药学专业学位3个硕士学位授权点，目前我们正在积极申报国家教育部中药学一级博士点和药学一级硕士点。
药学院有2个实验中心（药学基础教学实验中心和药学技能教学实验中心）、1个模拟药厂和正在筹建的科研大楼，两个实验中心皆为湖南省普通高校示范实验中心；中药现代化科研实验室为湖南省高校重点实验室；中药鉴定与资源实验室、中药药性与药效实验室为国家中医药管理局（三级）实验室。
目前药学院教学、科研实验室面积近20000平米，拥有气质联用仪、气相色谱仪、红外光谱仪、原子吸收分光光谱仪、高效液相色谱仪、倒置生物摄影显微镜、超临界流体提取装置等现代化大型精仪器280多台件，总价值达1800万元。
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