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我院成立于1950年，是我省规模最大的综合性医药卫生科研机构。我院现有在职人员390名，其中高级专业技术职称100人，院士2人，享有政府特殊津贴40人，有6人被评为国家有突出贡献中青年科技专家，有11人列为浙江省跨世纪学术和技术带头人。设有病毒病、生物工程、寄生虫病、药物、卫生学、计划生育、保健食品、医学情报、实验动物等9个研究所（中心）以及WHO人类蠕虫病合作研究中心、WHO人类生殖合作研究中心、国家甲型肝炎减毒活疫苗毒种保存中心、国家药品临床研究基地、国家新药安全评价研究重点实验室、浙江省实验动物与安全性评价重点实验室、浙江省中药新药研究开发中心等。院内拥有病原分子生物学、药学、劳动卫生学、营养学四个省级医学重点学科和病原生物学、药理学、药剂学、劳动卫生与环境卫生学四个硕士学位授予点。此外，我院还被卫生部确定为化学品毒性鉴定机构，被卫生部、农业部确定为农药毒理学试验认可单位和卫生部医药科技项目查新咨询单位。
改革开放以来，全院每年承担国家和省部级科研项目100余项，累计获奖科研成果200余项，其中国家发明奖3项（其中二等奖2项，三等奖1项）、国家科技进步奖11项、全国科学大会奖11项，国家发明专利13项。一些科研成果已跻身国际先进行列，如甲肝减毒活疫苗的研究开发成功并实现产业化，在控制甲肝流行方面取得了重大突破；各类避孕药药代、毒代动力学和长效避孕药物研究以及在男性生育调节因子和受精机理领域的研究成果，为我国的计划生育事业提供了有力的支持；血吸虫病防治药物研究及最优化控制方案成果，继续为我国控制和消灭血吸虫病作出贡献。同时，在新药和中药研究与开发，新药、农药、食品及化学品的毒理研究与安全性评价，寄生虫病、传染病、地方病、职业病等防治研究，以及医药卫生信息技术研究等方面取得了较大的成绩，为促进我省医药卫生事业和经济建设发展作出了贡献。
“十一五”期间，我院坚持以科学发展观为指导，弘扬“创新、服务”精神，以学科建设和技术创新为主线，以人才培养和团队建设为根本，以平台建设和科技成果转化为依托，以改善科研环境为保障，全面提升管理服务软实力，把我院建设成为“在全省医学科研中发挥引领作用、在全国医学科研前沿占一席之地”的省级重点科研院所，为浙江经济社会发展和保障人民健康服务。
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