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上海交通大学农业与生物学院的前身是上海农学院。1999年9月，有着40年历史的上海农学院并入上海交通大学，成立了上海交通大学农学院，2003年3月将农学院更名为农业与生物学院。
学院下设植物科学系、动物科学系、园林科学与工程系、资源与环境系、食品科学与工程系共5个系；设有实验教学中心、现代农业工程训练中心、公共仪器平台、植物生物技术研究中心、上海交通大学成人教育学院农业与生物学院分院；有挂靠学院的“上海交通大学新农村发展研究院”、“上海交通大学陆伯勋食品安全研究中心”等部门。学院拥有上海市重点学科5个（作物遗传育种、兽医传染病与预防兽医学、农艺学、园林学、蔬菜学）；拥有农业部都市农业（南方）重点开放实验室、科技部注册的中美食品安全联合研究中心、上海市兽医生物技术重点实验室。
学院现有5个专业（植物生物技术、动物生物技术、资源环境科学、园林、食品科学与工程）培养本科生；有13个二级学科硕士学位点（蔬菜学、果树学、植物病理学、农药学、动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖、草业科学、食品科学、预防兽医学、园林植物与观赏园艺、作物遗传育种学、生态学、植物学）培养全日制硕士研究生；有3个硕士专业学位点（农业推广、兽医推广、风景园林）培养专业学位研究生；有7个一级或二级博士学位点（环境科学与工程、预防兽医学与畜禽产品安全、生物技术、食品冷藏工程、植物学、生态学、蔬菜学）培养博士研究生；拥有蔬菜学博士后流动站。2008年底在校本科生536人、全日制硕士研究生218人、博士研究生105人。
学院以学科梯队建设为抓手，进一步凝炼学科，建有3个研究团队、14个研究方向，科学研究能力和水平明显提高。目前，在研的国家“863”、“973”、自然科学基金、科技部攻关、星火计划及市重点等重大重要项目60余项；科研经费大幅增长，2006年为2700万元，2007年超过2800万元，2008年达4500万元。近三年来，共获得上海市科技进步一等奖一项、二等奖四项、三等奖三项。2006年，SCI收录论文70篇、EI收录论文34篇，申请专利74项，获专利授权32项，品种审定11项；2007年，SCI收录论文71篇、EI收录论文8篇，专利受理57项，获专利授权44项，品种审定7项；2008年，SCI收录论文70篇、EI收录论文22篇，专利受理66项，专利授权13项，品种审定12项。
学院始终把国际化交流和办学作为学院实现跨越式发展的有效途径，目前与美、英、法、德、日等国家的世界知名大学建立了良好的合作交流，特别是同美国康奈尔大学、英国诺丁汉大学、美国加州大学戴维斯分校等相关农业与生命科学学院签订了合作协议，为合作办学、教师的学习交流、科研合作等打下了基础。
学院贯彻人才强院战略、交叉集成战略、国际化战略和社会服务战略，坚持科学发展观，探索研究型大学农科发展道路；吸取国外先进办学思想，提升学院办学理念；坚持“有所为、有所不为”的原则，凝练学科梯队，有选择地发展强势学科，构建创新平台，努力实现跨越式发展。学院的目标是瞄准国际农业与生命科学发展的趋势，以国际一流综合性大学现代农科发展框架为建设标准，创出一流综合性大学建设现代农科的新途径，若干学科在国内同类院校中排名前列，成为中国现代农业的一流农科和高端人才的培养基地之一。
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