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中医医史文献是从史学、文献学的角度，研究中医药学理论与经验、学术特征、文化内涵与发展规律的一门学科，是中医学重要的基础学科。本学科由我校著名中医专家任应秋教授于50年代创建，1981年首批批准为博士学位授权点，1996年我校中医学一级学科被批准为博士后流动站，本学科是流动站基地之一，目前形成了医学人文系为主、以中医信息研究室、中医文化研究中心、医史博物馆为支撑的合理布局。现有正副教授24人，师资力量雄厚，其中鲁兆麟教授和钱超尘教授为著名中医专家和学术带头人。本学科的4门主要课程（各家学说、医学史、医古文和中医文献学）均为全国教材的主编，并为中华中医药学会各家学说专业委员会、医古文研究会和李时珍研究会的主任委员单位，医学史分会、中医文献学分会和中医文化分会副主任委员单位。1995年以来，主持和参与各级课题53项，发表论文336篇，出版著作88部，获国家级奖1项，部局级奖13项，学科整体优势明显，在全国高等中医院校同类学科中处于领先地位。 本学科的研究方向有4个：
1.中医学术发展规律及流派研究 通过深入研究历代名医的学术思想和临床经验，探讨中医学术流派的形成和发展，进而揭示中医学术发展的内在规律，并凸显中医各家理论对临床的指导意义和实用价值。尤其侧重于近现代北京地区医学流派学术上的传承、发展与推广应用。
2.中医临床文献研究 以病证为研究切入点，探讨古今中医文献有关各病证的学术发展源流，阐述历代医家对各病证病因病机、诊断治疗的认识与发展沿革，总结他们诊治各科病证的学术理论和临证经验，为提高当今诊疗水平和临床疗效服务。
3.中医文化研究 从外史角度、利用诠释学的方法，研究中医学形成的文化社会背景、总体发展规律及其学术特征、思维方法，阐明中西医学临床思维的异同，从文化研究回归到医学研究，以促进中医药学术的发展。
4.中外传统医学比较与交流史研究 通过比较研究，寻找中西医学的交叉点和突破点，探索中西医学结合的新思路，为当今中医药走向世界提供依据；并通过东西方医学文化交流史和中医药西传波斯、南亚，东传日本、高丽的历史实证研究，证明中医学在历史上对世界医学产生深刻而广泛的影响。
研究方向特色为（1）文献研究与临床密切结合；（2）以文化研究为起点，以医学研究为目的；（3）符合未来医学科技与人文相结合的发展模式；（4）与北京市文化经济建设、中医药事业发展密切相关。
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