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1、养殖领域
养殖领域（095105）是有关该领域应用技术开发与推广的专业性学位，侧重于水产养殖种质种苗、安全养殖工艺与技术、养殖水域环境管理与评估方面新技术开发与应用，为水产养殖有关教育、科学研究、开发、以及技术推广与管理部门培养应用型、复合型高层次技术和管理人才。
我校养殖领域农业推广硕士专业学位主要面向种质与种苗工程、安全养殖技术、现代养殖设施工程技术及水域环境管理与评估等方向开展人才培养。本硕士点设在水产学院，由水产学院、海洋科学学院和海洋与渔业研究所联合举办，依托水产养殖学校重点学科、海洋生物学省重点学科（海洋生物学硕士学位点）和“海洋渔业科学与技术”浙江省重中之重学科。
我校养殖领域设有浙江省海水增养殖重点实验室、深水网箱省级高新技术研究开发中心、中俄浙江东海海洋养殖工程技术研究中心、中挪海水鱼类营养与饲料联合实验室、农业部渔业环境及水产品质量检验监督测试中心（舟山）、浙江省海水养殖病害防治中心、渔业科学研究所、海洋科学研究所等科研机构，设有博士后科研工作站，配有海水养殖装备与工程技术重点实验室、生物化学与分子生物学重点实验室、海水养殖生物遗传与发育实验室、海洋生物资源和分子工程实验室、水产养殖、海洋生物等水产养殖相关实验室，并与国内外相关科研院校、渔业主管部门和渔业生产企业建立了良好的合作关系。现有专业教师及科研人员36名，其中具有正高职称的12人，副高职称的16人，博士学位9余人，其中国家有突出贡献中青年专家、全国劳动模范、全国优秀农业科技工作者、省农业科技突出贡献者入选浙江省“151人才工程”重点资助对象各1人、省农业科技先进工作者和省中青年学科带头人各2人。现有高级职称成员中，绝大多数具有较为丰富的养殖生产一线经验，部分还具有指导硕士、博士研究生的经历。
历年来，养殖领域在学科在对虾工厂化全人工育苗、海带南移养殖、紫菜养殖、深水网箱养殖技术、水生生物高产安全精养模式、滩涂敌害防控等方面取得了一批在国内有较大影响力的科研成果，曾获国家科技进步一、二、三等奖各1项、全国科学大会奖3项、省部级科技奖励20多项，为我省乃至我国的水产养殖事业的发展做出了积极的贡献，赢得了良好的社会声誉。
近年来养殖领域先后承担了国家“863”、国家科技支撑计划和农业部、教育部、海洋局及浙江省科技厅等省部级以上项目60余项，出版《深水网箱养殖技术》等著作和教材10余部，发表论文300余篇。
2、渔业领域
渔业领域（095108）农业推广硕士专业学位是有关该领域应用技术开发与推广的专业性学位，侧重于渔业新技术开发与应用，为渔业有关教育、科学研究、开发、以及技术推广与管理部门培养应用型、复合型高层次技术和管理人才。
我校渔业领域农业推广硕士专业学位主要面向现代渔业工程、海洋生物资源与环境和渔业管理等方向开展人才培养。本硕士点设在水产学院，由水产学院、海洋科学学院和海洋与渔业研究所联合举办，依托捕捞学、渔业资源学、水产养殖学、海洋生物学学科、海洋渔业科学与技术学科。捕捞学始建于1958年的舟山水产学院，是省内唯一设置的学科，1997年起捕捞学学科被浙江省教委批准为省重点学科，2004年海洋生物学学科被省教育厅批准为省重点学科，2008年，海洋渔业科学与技术专业被列为省重中之重学科。渔业资源学、水产养殖学均为校级重点学科。2006年捕捞学和海洋生物学学科获硕士学位授予权，目前已招收三届硕士研究生。
在渔业领域，学校设有农业部渔业环境及水产品质量检验测试中心、东海区渔业资源动态监测网浙江省监测站、浙江省海水增养殖重点中试基地、浙江省渔业环境监测站、浙江省远洋渔业培训中心、深水网箱省级高新技术研究开发中心、浙江海洋学院渔业科学研究所、海洋资源与环境科学研究所等多个科研机构。建有海洋渔业、资源与环境、海洋生物等一批水产类实验室。并与国内外相关科研院校、渔业主管部门和渔业生产企业建立了良好的合作关系。
渔业领域现有专业教师及科研人员60余人，其中具有正高职称的14人，副高职称的30余人，博士学位10余人，享受国务院特殊津贴5人，入选浙江省“151人才工程”第一、二层次5人，省中青年学科带头人4人，全国劳动模范1人，省农业科技突出贡献奖1名，省农业科技先进工作者2人。
历年来，渔业领域曾获国家科技进步一、二、三等奖各1项、全国科学大会奖6项、省部级奖50多项，为我省乃至我国渔业的发展做出了积极的贡献，赢得了良好的社会信誉。近5年来，渔业领域承担了国家科技支撑计划项目、国家自然科学基金、国家“863”计划项目、国家星火计划项目、浙江省科技厅重大攻关项目、省自然科学基金等科研项目80余项，研究经费6000多万元，获国家和省部级科研成果奖近20项，出版著作/教材20余部，发表学术论文300余篇，若干领域研究水平和众多研究项目居国内先进、省内领先水平。
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