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南京林业大学化学工程学院的前身可以追溯到1929年和1933年，由著名林学家、教育家、新中国首任林业部部长梁希先生先后在浙江大学和中央大学创办的森林化学室。1952年由南京大学（原中央大学）和金陵大学两所高校的森林系合并组建南京林学院（现南京林业大学），并以森林化学室为基础设置了林产化学加工专业。1959年成立林产化学工程系，1993年更名为化学工程学院。2008年下半年，学校进行学科调整，将本院轻化工程和印刷工程两个专业组建成立轻工科学与工程学院。经过几代人的不懈努力和半个世纪的历史积淀，化学工程学院已发展成为以植物资源化学利用为特色，以林产化工、生物工程等专业为优势，以化工类专业为主的多学科协调发展的学院。
学院拥有“林产化学加工工程”国家级重点学科， “林产化学加工”部级重点开放性实验室。拥有林业工程（含林产化工二级学科）博士后流动站，林产化学加工工程、植物纤维化学与工程、生物质能源科学与技术等3个博士点，以及林产化学加工工程、生物化工、环境工程、化学工艺、材料加工工程、植物纤维化学与工程、生物质能源科学与技术等7个硕士点。设有林产化工、化学工程与工艺（含精细化工、生物资源化学与工程、化工过程与控制等3个方向）、生物工程（含生物化工、生物制药等2个方向）、环境工程、高分子材料与工程（生物高分子材料方向）5个本科专业，其中林产化工专业为国家和江苏省的特色专业、江苏省品牌专业。
学院下设林产化学工程系、精细化工系、化工过程与控制系、生物工程系、环境工程系以及材料科学与工程系，并设一个面向校内外的现代分析测试中心，以及森林植物化学工程、生物化工、木材保护三个研究所。学院现有在职教职工77人，其中教授18人、副教授、高级工程师21人，博士生导师14人，硕士生导师34人，在校博士、硕士、本科生1700余人。
几十年来，学院为国家培养和输送了一批又一批博士、硕士和本科等各层次的专业人才，许多毕业生已成为教学、科研、行政管理和生产经营等各行业的骨干和中坚。学院高度重视毕业生就业工作，建立了立足华东、遍布全国的就业基地，就业渠道广阔。改革开放以来，学院完成国家、省部级科研项目340余项，30余项科研成果获国家、省部级奖励。近五年来，有科研成果2项获国家技术发明二等奖、1项获国家科技进步一等奖、1项获国家科技进步二等奖。学院与12所国外大学建立了合作关系，进行院际学术交流，联合培养研究生以及部分专业的本科生。
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