海洋环境与工程学院现有环境与安全工程系、港口与航道工程系，1个硕士点（港口、海岸及近海工程）、4个本科专业（环境工程、安全工程、港口航道与海岸工程、船舶与海洋工程）。学院目前下设环境工程教研室、安全工程教研室、港航工程教研室、船舶工程教研室和环境工程实验中心、港航工程实验中心。
学院现有专任教师30余名，其中正副教授13名，其中3名博士生导师，专任教师中具有博士学位的教师比例达82%。
学院目前共有五千多平米的教学、科研实验场地，近年来共计投入资金近两千万，学院已基本具备相关的基础和专业实验室、拥有上海市高水平特色项目（绿色港航环境科学研究基地）、国际持久性有毒有害物质联合研究中心、上海市“现代造船设计制造技术公共实训基地”。
海洋环境和海洋工程已被我校列为“十一五”重点发展学科领域。环境工程、港口海岸与近海工程被立为校重点学科，有四门课程被立为校重点课程。目前学院“土力学课程教学团队”被评为第二届上海市级教学团队，拥有校优秀教学团队一个。
学院主要涉及的研究领域有：船舶及港口防污染技术、海洋运输安全工程管理、近海海域环境污染控制技术、海岸带环境信息技术、现代船舶制造工艺、航道与海岸工程技术等。
近年的科研情况：学院共获得科研项目四十余项，合同经费五百八十余万，其中：国家级项目四项、省部级项目六项。公开发表论文 七十余篇，其中检索论文二十余篇。申请专利四项。曾荣获2008年上海市科技进步三等奖、2009年安徽省科技进步二等奖。
我院已与沪东中华造船集团公司、中国海运集团公司、中交三航局、上海海域发展有限公司、国家海洋局东海监测中心、浦东新区环卫局等相关企事业单位签订合作办学协议，作为我院学生实习基地。
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