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临床医学院
临床医学院暨附属医院是一个集教学、医疗、科研和人才培养为一体的综合性医学教育、医疗和科研机构，临床医学院与附属医院合一管理，位于风景秀丽的苍山东麓、洱海西畔，有优雅的学习环境和优美的就医环境，整个医院充满了人文气息，充分实现了医教研相长和优势互补。设有19个教研室、31个临床医技科室和1个临床技能培训中心，拥有近1亿元的先进医疗科研仪器设备。现有教职员工（含医教护技）609名，其中高级专业技术职称人员104人，其中教授（含主任医师）24人，副教授（含副主任医师）80人，具有博士、硕士学位人员46人，硕士生导师30人。
临床医学院前身是原大理医学院，设有临床医学本科和医学影像学本科专业，目前在校学生达1500多名。其中临床医学本科专业是原大理医学院建院即开办的本科专业，也是本校本科办学历史最长的专业，是学校重点建设专业及省级重点建设专业。该专业从1982年开始招收本科生，现辐射东南亚，已培养出本科毕业生23届，并已招收四届南亚、东南亚留学生400多名。
学院师资队伍强大、技术力量雄厚、教学科研条件优越、学习和学术气氛浓厚。近年来，主持各级各类科研课题83项，其中国家自然科学基金项目1项，云南省自然科学基金2项，教改立项课题11项，科研经费80多万元；取得了36项教学、科研成果，其中获得省级科研成果奖2项、省级教学成果奖2项。为培养高层次、高素质的医学专门人才创造了良好的平台，为保证研究生教育和研究生培养质量提供了条件。2003年，儿科学获批硕士点以来，内科学和外科学相继获批为硕士点，自2004年以来已招收六届硕士研究生。
内科学
内科学是临床医学专业的主干课程，于2007年被评审为省级精品课程。主要有心血管疾病基础与临床、肾脏病基础与临床、血液病基础与临床等研究方向。本学科点有专职教师14人，其中教授5人，副教授5人，硕士6人，博士1人，硕士研究生导师6人。2007年开始招收研究生，已招收了3届。已完成教育厅与卫生厅的科研课题4项，现承担在研的省级科研课题5项，教改课题获云南省教育厅教学成果二等奖1项，在正式学术刊物上公开发表学术论文70余篇，具有较强的教学、临床与科研能力。
儿科学
儿科学是一门研究小儿生长发育规律，提高儿童保健及疾病防治质量，为儿童服务的医学科学。从体格、智能、行为和社会各方面研究和保护儿童，达到改善小儿体质、降低儿童发病率和死亡率并保障儿童健康的目的。本学科2003年获批成为学校首批四个硕士点之一，具有较为丰富的研究生培养和管理经验，主要依托临床医学院和附属医院，并与昆明市儿童医院和大理州人民医院联合培养研究生，主要研究方向有小儿内科、小儿外科和小儿眼科。其中小儿外科研究方向研究生培养基地是目前我省能承担小儿外科方向硕士研究生教育的唯一基地。
本学科点实力雄厚，集医、教、研为一体，现有教授6人，副教授4人，具有博士硕士学位教师6人，云南省学术技术带头人1人，承担云南省自然科学基金和云南省人才培养基金的多项科研项目，参编多部学术专著。从2004年开始招收硕士研究生，为研究生培养创造了良好的条件，在研究生培养过程中注重对研究生科学研究能力、临床工作能力和学术交流能力的培养和训练，坚持培养为医学事业献身的高素质医学专门人才的培养目标，已毕业研究生25人，均获得硕士学位，毕业研究生受到用人单位的欢迎。
外科学
外科学是临床医学中最重要的学科之一，是以手术和手法为主要治疗手段的学科，不仅要研究外科疾病的诊断、预防和治疗，而且还要研究疾病的发生和发展规律。
大理学院的外科学是云南省级精品课程和校级精品课程，是校级重点建设学科。本学科2006年获批为学校八个硕士点之一，具有较为丰富的研究生培养和管理经验，主要依托临床医学院。外科学硕士研究生指导教师分布在临床医学院（大理学院附属医院、云南省第四人民医院）、云南省第三人民医院和大理州人民医院，主要有普通外科、骨科、心胸外科、神经外科、整形外科、耳鼻咽喉与头颈外科、外科病理与分子病理、超声介入和放射介入等9个研究方向。
本学科点实力雄厚，集医、教、研为一体，外科学硕士研究生指导教师中现有教授14人，副教授3人，具有博士学位教师5人，具有硕士学位教师5人，承担云南省自然科学基金、云南省人才培养基金和云南省教育厅科学研究基金的多项科研项目，参编多部学术专著。从2007年开始招收硕士研究生，为研究生培养创造了良好的条件，在研究生培养过程中注重对研究生科学研究能力、临床工作能力和学术交流能力的培养和训练，坚持培养为医学事业献身的高素质医学专门人才的培养目标。
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