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一、无机化学专业
本学位点拥有先进的实验条件，在分子基磁性材料、超声场中材料改性、掺杂超细粉体材料制备、晶体材料和电子功能材料等方向的研究有自己的特色和较高的水平。有一批素质较高的学术带头人。
研究方向：无机材料化学 功能配合物化学 纳米材料化学 无机合成与材料
二、分析化学专业
本学位点是云南省唯一的分析化学硕士点，已培养了百余名研究生。所培养的研究生具有宽口径、厚基础、应用性强的特点，受到了烟草、质检、制药、环保及高校、科研部门等用人单位的广泛好评。
研究方向：分离科学 生物分析化学 环境分析化学 药物分析化学 材料分析化学
三、有机化学专业
本专业拥有一批学术素养高、结构合理的教师队伍，形成了有机合成化学及其方法学、天然产物化学、生物有机化学及应用有机化学四个有特色的研究方向。已累计培养硕士研究生200余名，并于2003年获得了博士学位授予权，成为云南省化学类唯一具有博士学位授予权的专业。
研究方向：有机合成化学及其方法学 天然产物化学 生物有机化学 应用有机化学
四、物理化学专业
物理化学专业于1981年获得硕士学位点，经过20多年的建设和发展，拥有了一批学术素养高、结构合理的教师队伍，在理论化学、环境催化、金属腐蚀与防护、材料化学等领域形成了有特色的研究方向，取得了一批科研成果。完成国家、省部级科研项目20多项，已培养100多名硕士研究生，并与外单位合作培养了博士研究生7人，发表学术论文300多篇，获得国家、省部级等科研成果奖多项。
研究方向：理论化学 环境催化腐蚀与防腐 贵金属材料化学
五、药物化学专业
本学位点是云南大学“十五”“211”工程建设的国家级重点学科之一“天然药物与生化药学”的支撑学科，主要涉及药物合成及构效关系研究、民族民间药用植物化学成份的研究、蛋白质及多肽化学研究、药物分析化学研究等领域。拥有一流的研究条件，设有药物合成、活性天然产物分离及结构鉴定、药物筛选模型、药物代谢及药物分析等研究室；并拥有核磁共振仪、色-质联用仪、制备型高效液相色谱仪、蛋白质纯化仪等一批大型精密仪器。
研究方向：药物合成及工艺 民族民间药用植物有效成份研究药物活性筛选及构效关系研究 药物分析方法研究 生物制药
六、应用化学专业
云南大学应用化学专业始创于1987年，是云南省最早建立的应用化学专业。本专业于2005年获得硕士学位授予权。目前承担多项科研项目，并且与一批企业建立了长期的合作关系，拥有进行高层次人才培养所必须的良好的实验设施、科研条件及生产实习基地。应用化学专业拥有一支教学经验丰富、科研实力较强、结构合理、有稳定研究方向的学术梯队，是云南大学重点建设专业。
研究方向：催化化学 天然产物化学 精细合成化学 水处理化学
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