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食品与制药工程系是在基础雄厚的化学和应用化学学科的基础上，为适应新世纪的发展目标，培养社会和市场经济需要的复合型理工科人才新成立的工程系，于2006年3月新组建的。经过调整和完善学科专业结构，已经基本形成以工为主，理工结合的专业格局。现有制药工程、食品科学与工程两个本科专业，并分别于2003年、2005年招生。
全系现有教职工20人，其中专任教师15人。教师中教授3人，副教授6人，高级职称教师占教师总数的45%；博士10名（含在读2人），硕士5名，硕士以上学历教师占教师总数的75%。设有8个实验室（食品工艺实验室、食品分析实验室、化工基础实验室、计算机辅助设计平台、药物化学实验室、药物工艺实验室、药物分析实验室和药剂学实验室）。
在学院“理为基础，理工结合，发展工科”的办学指导思想下，食品与制药工程系以本科教学为主体，进一步整合教学资源，依托基础专业学科优势，培养基础扎实、知识面宽、创新能力强、较高综合素质、较强适应能力，具备基础理论和基本实验技能的工程类高级技术和管理人才。充分发挥作为工程专业教学和科研（实验室）平台的优势，在全面拓展学生综合素质的基础上，加大学生实践教学环节的培养力度，注重学生实际能力的提高，坚持以实践教学为重点的人才培养模式，形成鲜明的办学特色。
学科介绍
食品科学与工程
食品科学与工程是以化学、生物、物理、化工及机电等学科为基础，研究食品安全与质量、现代食品加工基本理论和应用技术的综合性交叉学科。食品科学与工程的学生不仅要熟练掌握必要的数学、物理、化学、生物学、化工及机电等方面的基本理论和技能，同时还要具备食品工程与工艺、食品营养与卫生、食品分析及保鲜与存储等食品科学与工程方面的专业知识。本专业在开设高等数学、普通物理、食品化学及生物化学、食品微生物学和化学专业的主要基础课及相关实验课程的基础上，开设了食品工艺学、食品工程设备以及食品分析化学、食品保藏技术原理等专业必修课，并设置了以适应WTO要求的食品检测与质量控制为特色的食品安全与质量和以云南省丰富的资源为基础、以现代食品尤其是功能食品开发与加工理论及技术为特色的现代食品工程两个专业方向。
研究方向一
食品安全与质量控制方向
研究方向二
现代食品工程方向
制药工程
制药工程专业是奠定在药学、生物技术、化学和工程学基础上的交叉学科，是一门工程技术科学，主要解决药品生产过程中的工程技术问题和实施药品生产质量管理规范，实现药品的规模化生产和规范化管理。本专业在开设高等数学、普通物理、药物化学及生物化学和化学专业的主要基础课及相关实验课程的基础上，开设了制药工艺学、制药工程设备以及药物分析、药剂学等专业必修课，并设置了创制新药为特色的化学制药方向和以云南省丰富的资源为基础、以中药创制和发现新药为特色的中药制药两个专业方向。
研究方向一
化学制药方向
研究方向二
中药制药方向
专业建设
食品科学与工程专业建设规划
一、学科专业方向
培养目标：本专业以食品安全与质量控制及现代食品工程为学科方向，培养具有良好的政治素质与道德修养，掌握必要的化学、生物学、食品分析化学、食品工程与工艺、食品安全与卫生等方面的基础理论和基本实验技能，熟悉与食品相关的政策法规、适应21世纪食品及相关行业和社会发展需要，能在现代食品企业、食品卫生监督部门、海关、商检、卫生防疫及环保部门等从事食品新产品开发、食品加工、食品工程设计、食品分析检测及与食品安全与质量相关的技术、管理、策划和科学研究工作，也能到科研院所从事教学和科研工作的高级技术和管理人才。毕业生还可进入化学、化工、食品科学与工程等相关领域进一步深造。
培养要求：专业学生主要学习与现代食品工程及食品安全与质量相关的基本理论和基础知识。要求较熟练地掌握化学、生物学、食品分析化学、食品工程与工艺、食品安全与卫生等方面的基础理论和基本实验技能，熟悉食品工业的发展方针、政策和法规，懂得食品保鲜与贮藏原理，了解食品资源综合利用的技术和发展规律动态，具备运用所学的理论知识和实验技能，结合实际开展食品新产品开发、工艺设计、生产管理、食品分析与质量控制的能力。
二、教学计划建设
根据培养厚基础、宽口径、注重创新、适应需求的高素质人才目标来制定具有特色的教学计划和人才培养模式。以培养学生创新精神和实践能力为教育教学过程主线，2009年修订完善新的教学计划并正式颁布执行。在课程设置上强化工程类专业课的设置，优化实验课体系，增加设计型、综合型、创新型实验项目，培养学生学科基础技能和创新意识。建立以技术应用能力为中心的实践教学体系，实践教学体系以学生为主体，以实践能力培养为重点，通过理论启发、实践尝试、基本技能应用和技术创新等环节，培养高素质的工程类人才。主干课程要符合教育部颁布的高等学校本科专业教学要求，并体现出学科专业特色。学时为2800～3500学时。
三、课程建设
努力将食品科学与工程专业建设成为云南省学术水平较高、科研力量较强、具有相当影响的品牌与特色专业。重点建设主干学科，力争在三年内有一门主干课程列为校级重点课程，如食品化学、食品分析或食品工艺学等。
四、教材建设
根据培养计划，组织力量审定、选择适应于本专业培养目标的各类教材，制订新的教学大纲，明确每门课程的任务、目的、要达到的要求等，同时鼓励教师编写具有较高质量的讲义并编写食品工艺学、食品化学分析以及食品微生物学实验教材。
五、实验室建设
重点建设食品工艺和计算机辅助设计实验室，食品化学与分析和食品微生物实验方面的仪器可享用其他实验室资源，2010年的实验室建设面积达到500平方米，固定资产达到300万元。
六、师资队伍建设
2010年专业教师队伍达到10人，其中博士3～5人，硕士2～3人，高级职称教师达到5人。
制药工程专业建设规划
一、学科专业方向
培养目标：本专业培养适应我国社会主义现代化建设需要，德、智、体全面发展，掌握制药工程方面的基础知识和基本技能，具有一定的创新能力和应用开发研究能力，具备新药研制与开发及制药工艺等制药工程方面的知识和技能，能在医药、农药、精细化工和生物化工及其相关部门从事医药产品生产、科研、技术及相关管理和营销工作的理工结合型人才。毕业后可以到医药、农药、生物化工、精细化工等制药企业及化工企业、药物研究与开发单位、医药贸易企业和药证管理部门、医药院校等单位从事药物生产、新药研究与开发、药物分析、药物工程设计、药物制剂加工与设计、药物营销、药物管理等工作，也可进入更高层次的学习。
培养要求：本专业学生主要学习药物化学、天然药物化学、药物合成、生物化学、微生物学、药理学、毒理学、制药工艺学、药物制剂技术、化工原理、制药专业设备、药物分析等方面的基本理论和基本知识；受到化学与化工实验技能、工程实践、计算机应用、科学研究与工程设计方法的基本训练，具有对药物产品的生产、工程设计、新药的研制与开发的基本能力。
二、教学计划建设
根据培养厚基础、宽口径、注重创新、适应需求的高素质人才目标来制定具有特色的教学计划和人才培养模式。以培养学生创新精神和实践能力为教育教学过程主线，2009年修订完善新的教学计划并正式颁布执行。在课程设置上强化工程类专业课的设置，优化实验课体系，增加设计型、综合型、创新型实验项目，培养学生学科基础技能和创新意识。建立以技术应用能力为中心的实践教学体系，实践教学体系以学生为主体，以实践能力培养为重点，通过理论启发、实践尝试、基本技能应用和技术创新等环节，培养高素质的工程类人才。主干课程要符合教育部颁布的高等学校本科专业教学要求，并体现出学科专业特色。学时为2800～3500学时。
三、课程建设
努力确立制药工程在我校的重点学科地位，并进行重点建设。争取到2010年，将其建成教学体系完备、科研重点突出的优势学科，争取建设成校级重点专业。
四、教材建设
根据培养计划，组织力量审定、选择适应于本专业培养目标的各类教材，制订新的教学大纲，明确每门课程的任务、目的、要达到的要求等，同时鼓励教师编写具有较高质量的讲义并编写制药工艺学、药物分析以及药物化学、药剂学等实验教材。
五、实验室建设
重点建设制药工艺学和药剂学实验室，药物化学与药物分析分析和实验方面的仪器可享用其他实验室资源，2010年的实验室建设面积达到500平方米，固定资产达到200万元。
六、师资队伍建设
2010年专业教师队伍达到20人，其中博士5～8人，硕士3～5人，高级职称教师达到10人。
食品与制药工程系现有教职工20人，其中专任教师15人。教师中教授3人，副教授6人，高级职称教师占教师总数的45%；博士10名（含在读2人），硕士5名，硕士以上学历教师占教师总数的75%。
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