中国医学科学院皮肤病研究所1954年创建于北京，直属中央卫生部领导。1970年从北京迁至江苏泰州，1984年迁南京现址，并建立皮肤病医院。1986年设立全国性病防治研究中心，2005年调整为中国疾病预防控制中心性病控制中心、中国疾病预防控制中心麻风病控制中心。
该院所是我国最早成立的从事皮肤病、性病、麻风病，集临床、科研、防治和教学为一体的国家级专业机构。为世界卫生组织性传播疾病预防与控制合作中心、皮肤性病学国家重点学科、博士和硕士学位授予点、国家药品临床研究基地、中国微生物菌种保藏管理委员会医学真菌中心、江苏省临床医学中心、卫生部化妆品皮肤病诊断机构、中国医学科学院艾滋病研究中心性传播疾病控制中心、家庭健康国际中国合作中心，同时承担《中华皮肤科杂志》、《国际皮肤性病学杂志》的编辑和出版任务。
该院所占地4．04万平方米，建筑面积3．6万平方米，主要建筑有门诊楼、病房楼、医技楼、科研楼、教育防治业务楼、SPF级实验动物中心。医院编制床位100张，设有20多个临床、科研科室，年接诊病员约60万人次。300余名在职职工中，高级专家62名，博士生导师9名，硕士生导师23名，享受政府特殊津贴专家17名。50余名专家在国家及省级专业委员会任职。现有中青年骨干中，多人当选卫生部突出贡献专家、新世纪百千万国家级人选、江苏省“六大高峰”人才和医学重点人才。
五十载春华秋实，半世纪艰苦创业，全体职工秉承“严谨、博精、创新、奉献”的协和精神，与时俱进，开拓创新，坚持医教研防齐头并进，协调发展。医院充分发挥国家级医疗机构的作用，形成专科、专病特色和优势；坚持科研兴所导向，科研工作成果丰硕；防治工作取得重大成就；国际间学术交流与合作日益扩大和频繁；人才建设和培养已形成梯队。经过几代人不懈努力，院所焕发出勃勃生机，彰显出强有力的发展后劲，激励着我们不断继承传统、改革创新，成就又一个辉煌。
第一部分：世纪回眸
1954年在北京成立，原名为“中央皮肤性病研究所”，郭沫若题写所名；
1957年更名为“中国医学科学院皮肤性病研究所”；
1970年迁至江苏泰州，易名“江苏皮肤病防治研究所”；
1984年迁南京现址，易名“中国医学科学院皮肤病研究所”，并建立“中国医学科学院皮肤病医院”。
1986年在该院设立“全国性病防治研究中心”；2005年更名为“中国CDC性病控制中心”、“中国CDC麻风病控制中心”。
第二部分：医苑风貌
拥有国内最齐全的皮肤病性病学亚学科，并逐步建立以疾病为导向的学科建设模式。皮肤病理专业为国内该领域学科带头单位，皮肤真菌学的研究处于国内领先水平；性病临床和科研是国家公益基金支持项目；皮肤美容治疗，尤其是皮肤病的脉冲激光及皮肤病物理疗法优势明显；皮肤外科近年来发展迅速，成为该领域有影响的队伍。
该院所在国内最早开展专病诊治，经10余年的发展，在重症大疱病、结缔组织病、重症药疹的抢救、血管性肿瘤、疑难少见皮肤病和皮肤肿瘤、痤疮、白癜风等皮肤病的专病诊疗技术居国内领先水平，年接诊病员近60万人次。
第三部分：科研硕果
建院所以来，承担国家“七·五”、“八·五”攻关项目、国家自然科学基金、国家重大专项、科技部和卫生部公益专项、江苏省自然科学基金和国际合作等项目的研究。先后获国家科技进步一、二、三等奖、全国科学大会奖、部省市级奖和院校奖。每年在国内外核心期刊发表论文100余篇，专著10余部。《中国性病防治之梅毒》在世界著名医学期刊《柳叶刀》上发表。研制的雷公藤多甙已广泛用于治疗变态反应和免疫相关的疾病，其有效单体的研究被评为国家一类新药。自行研制皮肤科外用制剂百余种用于临床，受到病员的广泛好评。
第四部分：教书育人
皮肤性病学为教育部重点学科，北京协和医学院皮肤性病学专业博士、硕士学位授予点，卫生部认定的第一批国家级继续医学教育基地、中国医师协会皮肤病理、真菌、性病及美容专业全国培训基地。院所培养的皮肤性病学专业博士和硕士研究生，已成为全国三级医疗卫生机构的业务骨干。每年接受进修生100余名，完成10余期国家医学教育项目，组织20多期培训班，为各省市基层卫生医疗机构、疾病预防机构，培养皮肤性病专业诊疗和防治技术骨干，更好地指导基层的医疗卫生和防治工作。
第五部分：防治成就
院所防治工作者以完成国家任务为己任，经过二十余年不懈努力，已建立起一支具有光荣传统的，集临床、防治和科研为一体的团队，并设立了遍布全国的疫情监测网络。首任所长胡传揆教授代表国家在北京国际科学讨论会上宣读了“我国对梅毒的控制与消灭”的论文；“全国控制和基本消灭麻风病的策略和技术措施的研究”、“麻风畸残防治及康复研究”分别获得国家科技进步一、二等奖；15届麻风大会，我院所荣获“全国麻风防治工作先进集体”，实现了本世纪末我国基本消灭麻风病的目标，标志着我国性病、麻风病防治工作取得了举世瞩目的成就。
第六部分：国际交流
先后与WHO、美国NIH、欧盟、瑞士巴塞尔大学医学研究中心、国际皮肤病基金会、国际麻风病救济会、荷兰麻风基金会、法国佛里豪基金会、日本世川财团等30多个国际组织建立了学术交流与合作。定期邀请国际知名专家来所讲学、交流，同时选送优秀中青年医学、科研人员出国学习和培训。每年与WHO、欧盟、中英、世行卫九、福特基金等开展了数十项国际合作项目的科学研究。
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