西南大学植物保护学院，其前身是西南农学院植物保护系，始建于1952年， 2002年成为西南农业大学植物保护学院，2005年西南师范大学和西南农业大学合并后组建了西南大学植物保护学院。
学院现有教职工55名，客座教授12名。其中部级有突出贡献专家1名，享受政府特殊津贴者4名，教育部新世纪优秀人才支持计划入选者1名，中国农业科学院二级岗位杰出人才1名，重庆市学术与技术带头人及后备人选4名，巴渝学者特聘教授1名，重庆市名师1名；博士生导师7名，教授、研究员13名，副教授、副研究员17名，高级实验师1名。
学院现有植物保护一级学科博士点1个，下设植物保护学博士后流动站1个，涵盖植物病理专业、农业昆虫与害虫防治专业、农药学专业、生物安全专业4个博士、硕士学位授权。学院设有植物保护、生物安全和制药工程（农药方向）3个本科专业，4个教学实验室和6个教学实践基地，实验办公面积达6000平方米。目前，有重庆市精品课程3门，1个重庆市重点实验室，2个重庆市高校级重点实验室。已经培养本科生3600余名、硕士研究生270余名、博士研究生60名、博士后10名；同时为国内外培养应用技术人员1000余人次 。
“十一五”期间，学院获得各类科研项目100余项，经费2000余万元。其中，“973”前期研究项目1项，国家级项目20余项，省部级项目50余项。获得教育部长江学者及创新团队1个，获得省部级科技奖励5项，发表学术论文237篇。分别有2篇博士和3篇硕士学位论文获重庆市优秀学位论文，其中2篇博士学位论文分别获全国百篇优秀博士学位论文及提名奖。
建院以来，植物保护学院全体教职员工秉承“崇德尚学、务本致远”的院训，始终奉行“勤恳求实、无私奉献、以人为本、学术立院”的办学理念；以学科建设为龙头，教学、科研为中心，促进产学研紧密结合；为把植物保护学院建成国内有影响力的高水平研究型学院而努力奋斗。
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