水文水资源学院前身为1952年建立的华东水利学院水文系；1984年更名为水资源水文系；1995年，学校内部机构调整，水资源水文系和环境科学与工程学院合并，成立水文水资源及环境学院；2002年，调整为水资源环境学院；2007年更名为水文水资源学院。

　　1952年著名水文学家刘光文教授等创建新中国第一个水文系，1954年，创建我国第一个陆地水文本科专业，并于1955年开始招收研究生，是我国第一批培养研究生的学科点。1981年首批获得学士、硕士和博士学位授予权。1988、2002和2007年水文学及水资源学科连续三次被评为国家重点学科。1993年建成水资源开发利用国家专业实验室，2001年，获批设立水资源开发教育部重点实验室，2004年获批为水文水资源与水利工程科学国家重点实验室。2005年获批建设水资源高效利用与工程安全国家工程研究中心。1996、2002和2008年分别列入“九五”、“十五”和“十一五”国家“211工程”重点学科建设项目。

　　学院现设有水文与水资源工程系、水务工程系和城市资源环境系；水文预报研究所、工程水文及水文气象研究所、水资源研究所、水文水利自动化研究所、城市水务工程研究所、水生态环境研究所、干旱研究所、中德水资源研究所；全球变化与水循环研究中心、平原河流与湖泊水文研究中心；河海大学水问题研究所和国际河流研究所；水资源环境实验中心。1997年，联合国教科文组织通过专门议案，在我校设立UNESCO国际水文水资源及环境培训与研究中心。

　　学院现有教职工97人，双聘院士5名，长江学者1名，教授31名，博士生导师25名，副高25名，具有博士学位者70人。学院拥有水利学科博士后流动站；三个博士学位授权点：水文学及水资源、城市水务、生态水利学；五个硕士学位授权点：水文学及水资源、城市水务、生态水利学、自然地理学和人文地理学，并招收水利工程硕士学位研究生；设有水文与水资源工程、水务工程、资源环境与城乡规划管理三个本科专业。2010年学院在校研究生582名，本科生991人，在读工程硕士研究生500余人。2000年以来主持与承担1000余项包括国家“973”课题、“863”课题、国家自然科学基金、国家科技攻关和直接服务于国民经济建设的科研项目，经费总额3．2亿元，发表论文3000余篇，出版专著和教材30多部，获部省级以上科技奖近60项，参与国际学术交流300多人次，拥有教育部长江学者创新团队。

　　多年来，学院一直秉承“继承与发展”的方针，注重学术积累，已逐步形成覆盖水文、水资源、水环境及3S技术应用领域的比较稳定的研究方向，有一支理论基础深厚、实践经验丰富的老、中、青相结合的学术带头人和学术骨干队伍，有全国较齐全的水文图书资料和先进的实验研究设施，并与国内外水文水资源领域著名的学术机构建立了良好的合作关系。学院紧密跟踪与引导学科发展趋势，积极参与解决国民经济建设中的重大水文水资源及环境问题，总体上居国际先进水平。