电气工程学院历史悠久，其办学历史可追溯到1923年成立的国立东南大学电机系。从中央大学、南京工学院、到今天的东南大学都一直设有电气工程相关学科和专业。曾经有大批国内外学术界知名的专家、学者在学院工作，如：吴玉麟、陈章、吴大榕、程式、杨简初、严一士、闵华、周鹗、陈珩等。
电气工程学院现设有电气工程一级学科博士学位授权点，含电机与电器、电力系统及其自动化、电力电子与电力传动、高电压与绝缘技术、电工理论与新技术、应用电子与运动控制、电气信息技术和新能源技术等二级学科，其中，电机与电器、电力系统及其自动化两个二级学科为江苏省重点学科。设有电气工程博士后流动站和电气工程及其自动化本科专业。电气工程学院是国家“211工程”、“985工程”一期、二期的重点建设单位，是教育部电气工程及其自动化专业教学指导分委员副主任单位。电气工程及其自动化本科专业是江苏省高等学校品牌专业，2006年6月又首个通过教育部工程教育专业认证。
目前，电气工程学院有专任教师50余人，其中教授22人（含博士生导师19人），副教授和高级工程师20人。专任教师中有博士学位的教师占70%，另有在职攻读博士学位的教师8人。博士后流动站博士后研究人员10人。有兼职院士1名、长江学者1名、国家杰出青年基金获得者2名、省级优秀骨干教师4名，省“333工程培养对象”2名，省“六大人才高峰”学术带头人2人，省“青蓝工程学术带头人”2名，国家教育部优秀骨干教师1名，享受国务院“政府特殊津贴”的有12名。
电气工程学院坚持本科生教育与研究生教育并重、教学与科研并重的方针，在不断加强本科生教育的同时，积极开展研究生培养和科学研究，每年招收硕士研究生和博士研究生130多名。近五年来承担了国家“863”高技术项目、国家自然科学基金项目、以及省部级项目数50余项，取得一批达到了国内外领先水平的重要研究成果。获得14项国家和省部级奖项、30余项国家专利、另有数十项成果通过了省部级鉴定，发表论文700余篇（其中三大检索300篇），出版学术专著8部。
近年来，电气工程学院积极开教学改革和研究，承担了国家、省和学校各类教改项目数十项，取得了一批教学成果，获得国家级教学成果奖2项、国家级优秀教材1项，省部级精品教材奖2项，出版“十五”和“十一五”国家级规划教材等15部。
学院拥有Rockwell自动化实验室、电力电子实验室、电机实验室、微特电机实验室、电力系统仿真实验室、计算机实验室等设备先进的实验室。近年新建了伺服控制技术教育部工程研究中心、南京市电气设备与自动化工程技术中心、东南大学-香港德昌电机联合研究中心、东南大学电力需求侧管理研究所、东大-中电联合研发中心、东大—金智联合研发中心、东大—南自通华电力电子研究中心、东南大学风力发电研究中心等，强化了科研与经济建设的结合。
电气工程学院与境外数十所知名高校和研究机构建立了稳定的合作关系，如亚琛工业大学（德）、苏黎士工业大学（瑞士）、谢菲尔德大学（英）、俄亥俄州立大学（美）、巴士（BATH）大学（英）、伦敦城市大学（英）、斯德莱克德大学（英）、伊阿华州立大学（美）、爱知工业大学（日）、莫纳什（Monash）大学（澳大利亚）、悉尼理工大学（澳大利亚）、香港大学和香港理工大学等，每年都互派学者讲学，交换留学生，开展联合科研等。每年亦邀请多位国际知名专家来校讲学、进行研究生联合培养等。另外，每年都派出10多位教师和研究生参加各类国际学术会议。2005年成功举办了大型国际学术会议“第八届国际电机与系统会议”，2008年又成功举办了DRPT08国际学术会议，提高了学院电气工程学科在国内外的影响和学术地位。
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